酵母基因组大尺度遗传操纵工具研究进展.docxVIP

生 物 工 程 学 报 Chinese Journal of Biotechnology /cjbcn DOI: 10.13345/j.cjb.230278 李杰奕 等/酵母基因组大尺度遗传操纵工具研究进展 Jun. 25, 2023, 39(6): 2465-2484 ?2023 Chin J Biotech, All rights reserved 2465 2465 ·关键核心技术 · 吴毅 天津大学化工学院英才教授、博士生导师，国家青年人才，国家重点研 发计划青年项目首席科学家。从事合成生物学研究，聚焦基因组大片段 DNA 的设计与操纵。代表性工作发表在 Science 、 Nature Communications 、ACS Synthetic Biology 等期刊，相关成果入选“ 中国科学十大进展” ，获得天津市自然 科学特等奖等。 酵母基因组大尺度遗传操纵工具研究进展 李杰奕 1,2 ，佟函泽 1,2 ，吴毅 1,2* 1 天津大学化工学院，天津 300072 2 天津大学 教育部合成生物学前沿科学中心和系统生物工程重点实验室，天津 300072 李杰奕 李杰奕, 佟函泽, 吴毅. 酵母基因组大尺度遗传操纵工具研究进展[J]. 生物工程学报, 2023, 39(6): 2465-2484. LI Jieyi, TONG Hanze, WU Yi. Tools for large-scale genetic manipulation of yeast genome[J]. Chinese Journal of Biotechnology, 2023, 39(6): 2465-2484. 摘 要： 基因组大尺度遗传操纵是指对基因组大片段 DNA 的敲除、整合、易位等遗传改造。相较 于小规模基因编辑，基因组大尺度遗传操纵可实现更多遗传信息的同步改造，对于探究多基因相互 作用等复杂机制的理解有重要意义。同时，基因组大尺度遗传操纵技术可对基因组开展更大规模的 设计重构， 甚至创建全新的基因组，在复杂功能重塑方面具有重要创新潜力。酵母是一种重要的真 核模式生物，因其安全性和易于操作而被广泛应用。本文系统总结了酵母基因组大尺度遗传操纵的 工具包， 包括重组酶介导的大尺度操纵、核酸酶介导的大尺度操纵、从头合成大片段 DNA 以及其 他大尺度操纵工具，介绍了它们的基本工作原理与典型应用案例。最后，对大尺度遗传操纵面临的 挑战和发展进行了展望。 关键词： 遗传操纵； 基因组工程； 大片段 DNA；酵母； 合成生物学 资助项目：国家自然科学基金；国家重点研发计划(2021YFC2102500) This work was supported by the National Natural Science Foundation of China and the National Key Research and Development Program of China (2021YFC2102500). *Corresponding author. E-mail: yi.wu@ Received: 2023-04-11; Accepted: 2023-06-05 2466ISSN 1000-3061 CN 11-1998/Q 生物工程学报 Chin J Biotech 2466 Tools for large-scale genetic manipulation of yeast genome LI Jieyi1,2, TONG Hanze1,2, WUYi1,2* 1 School of Chemical Engineering and Technology, Tianjin University, Tianjin 300072, China 2 Frontier Science Center for Synthetic Biology and Key Laboratory of Systems Bioengineering, Ministry of Education, Tianjin University, Tianjin 300072, China Abstract: Large-scale genetic manipulation of the genome refers to the genetic modification of large fragments of DNA using knockout, integration and translocation. Compared to s