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植物病毒分类研究进展 2012年，国际病毒分类委员会（icv）发布了关于病毒分类的第四次报告。 第九次报告中的植物病毒分别归属于3个目、21个科、3个亚科、89个属、950种, 比第八次报告增加了2个目、3个科、3个亚科、8个属、187种 1 第9版《植物病毒、科学、分工和其他动物》报告 1.1 伴生豆病毒科secovirus 新增的该目包括 (+) ssRNA动物病毒的小RNA病毒科 (Picornaviridae) 、双顺反子病毒科 (Dicistroviridae) 、传染性软化病病毒科 (Iflaviridae) , 藻类病毒的海洋RNA病毒科 (Marnaviridae) , 植物病毒的伴生豇豆病毒科 (Secoviridae) 。该目的设立突破了一个病毒目中只含有动物病毒或植物病毒的局限, 依据基因组分子进化关系来确定目分类阶元, 为今后设立更多的病毒目提供了参考。在伴生豇豆病毒科中, 原来的豇豆花叶病毒科降为豇豆花叶病毒亚科 (Comovirinae) , 原来的伴生病毒科 (Sequiviridae) 撤销, 保留伴生病毒属 (Sequivirus) 和水稻矮化病毒属 (Waikavirus) , 与樱桃锉叶病毒属 (Cheravirus) 、温州蜜柑矮缩病毒属 (Sadwavirus) 和一个新增的灼烧病毒属 (Torradovirus) 共5个属、1个亚科合并为伴生豇豆病毒科。灼烧病毒属包括2个种, 代表种为番茄灼烧病毒 (Tomato torrado virus) 。 1.2 网状病毒科的撤销 新增的该目包括 (+) ssRNA植物病毒的芜菁黄花叶病毒科 (Tymoviridae) 、甲型线状病毒科 (Alphaflexiviridae) 、乙型线状病毒科 (Betaflexiviridae) 以及真菌病毒的丙型线状病毒科 (Gammaflexiviridae) 。原来的线状病毒科撤销并作了较大调整, 将马铃薯X病毒属 (Potexvirus) 、葱X病毒属 (Allexivirus) 、印度柑橘病毒属 (Mandarivirus) 和一个新增的黑麦草潜隐病毒属 (Lolavirus) , 还有另外两个真菌病毒的灰霉X病毒属 (Botrexvirus) 、核盘菌减毒RNA病毒属 (Sclerodarnavirus) 合并为甲型线状病毒科。将香石竹潜隐病毒属 (Carlavirus) 、发样病毒属 (Capillovirus) 、凹陷病毒属 (Foveavirus) 、纤毛病毒属 (Trichovirus) 、葡萄病毒属 (Vitivirus) 和一个新增的柑橘病毒属 (Citrivirus) 合并为乙型线状病毒科。黑麦草潜隐病毒属的惟一代表种为黑麦草潜隐病毒 (Lolium latent virus) , 柑橘病毒属的惟一代表种为柑橘叶疱斑病毒 (Citrus leaf blotch virus) 。 1.3 平滑呼肠孤病毒基因 在呼肠孤病毒科中新设这两个亚科, 将植物呼肠孤病毒属 (Phytoreovirus) 以及轮状病毒属 (Rotavirus) 等其他5个病毒属归属于光滑呼肠孤病毒亚科。斐济病毒属 (Fijivirus) 、水稻病毒属 (Oryzavirus) 以及正呼肠孤病毒属 (Orthoreovirus) 等7个病毒属归属于刺突呼肠孤病毒亚科, 植物病毒各属的种和代表种不变。 1.4 rnavirus 原来的内源RNA病毒属 (Endornavirus) 升格为内源RNA病毒科, 该科只含一个内源RNA病毒属, 属内病毒种和代表种不变。 1.5 蛇形病毒科virus 原来的蛇形病毒属 (Ophiovirus) 升格为蛇形病毒科, 该科只含一个蛇形病毒属, 属内增加了香雪兰慢性病毒 (Freesia sneak virus) 一个种, 代表种不变。 1.6 真菌病毒属virus 新增的该科包括 (+) ssRNA病毒原来未归入科的烟草花叶病毒属 (Tobamovirus) , 真菌传杆状病毒属 (Furovirus) , 大麦病毒属 (Hordeivirus) , 花生丛簇病毒属 (Pecluvirus) , 马铃薯帚顶病毒属 (Pomovirus) , 烟草脆裂病毒属 (Tobravirus) 等6个属。除了烟草花叶病毒属增加了3个种外, 其他属内的种和代表种不变。 1.7 欧洲花楸环斑病毒属emp 在单分子负链RNA病毒目中新增该属, 未归入科, 其惟一代表种为欧洲花楸环斑伴随病毒 (European mountainash ringspot-associated virus) 。 1.8 天葵环纹测定病毒属anulavirus 在雀麦花叶病毒科 (Bromoviridae) 中新增该属