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機制II機制III7.4.2.1轉肽氨醯-tRNA進入A位後,肽醯轉移酶(peptidyltransferase)把P位上起始tRNAfMet所攜帶的甲醯甲硫氨酸轉移到A位的氨醯-tRNA的氨基上,形成肽鍵。在大腸桿菌中,肽基轉移酶活性位於大亞基的23SrRNA中。23SrRNA與處於A位和P位上的tRNA的CCA末端之間的堿基配對,協助氨醯-tRNA的α-NH2攻擊肽醯-tRNA上酯鍵的羰基,結果使一個酯鍵轉化成了一個肽鍵。7.4.2.3轉位在肽鏈延伸過程中,每一輪肽鍵的形成需要消耗一個ATP分子和兩個GTP分子。一個ATP分子被氨醯-tRNA合成酶消耗,形成連接氨基酸和tRNA的高能醯基鍵。這一高能醯基鍵斷裂所釋放的能量驅動肽醯轉移酶反應,形成肽鍵。一個GTP分子在EF-Tu將氨醯-tRNA運送至核糖體的A位點的過程中被消耗。另一個GTP分子在EF-G介導的移位過程中被消耗。7.4.3翻譯的終止肽鏈合成的終止與釋放肽鏈合成的終止與釋放細菌中有三種釋放因數:RF1、RF2和RF3釋放因數與核糖體脫離RF3促進RF1或者RF2與核糖體脫離。這一步反應需要GTP水解提供能量。核糖體的分離核糖體的分離7.4.4核糖體讀框移位通常,核糖體是嚴格按照mRNA的讀碼框合成蛋白質的。然而有少數的mRNA攜帶有特異性的序列資訊和結構元件使核糖體移抵達mRNA特定的位置時向上遊(-1)或者下游(+1)滑動一個堿基的距離,然後繼續蛋白質的合成,從而改變了mRNA的閱讀框。這種現象稱為程式性核糖體移框(programmedribosomalframeshifting,PRF)。NNNNUU-UUUUAGGNNNNNNNNNNU-UUU-UUA-GGN-NNN未發生移框閱讀發生移框閱讀RF-2recognizesUAAandUGA,whileRF-1recognizesUAAandUAGstopcodons.TheRF-2ORFcontainsanin-frameUGAstopcodonandagoodSDsequence3nucleotidesupstreamoftheframeshiftsite(5′-CUUUGAC-3′).WhentheRF-2levelislow,theribosomepauseswhenaUGAcodonislocatedintheAsite.tRNAleuinthePsitethenslipsfromtheCUUcodontotheUUUcodon.FrameshiftingisenhancedbythepresenceofSD-likeelement3nucleotidesupstream(suggestsapush-forwardmechanism?).Inthisway,moreRF-2ismadewhenthereisnotenoughtorapidlyterminatetranslationattheUGAstopcodon.RF2expressioninbacteriaissubjecttofeedbackcontrolbyitsownactivityWhilerareincellulargenes,-1frameshiftingoccursintheE.coliDnaXgeneTheE.coliDnaXgeneencodestwosubunitsofDNAPolymeraseIII:the?subunitistheproductofnormaltranslation,whilethe?subunitisderivedby-1frameshifting.Frameshiftingoccursattheslipperysequence5′-AAAAAAG-3′bysimultaneousslippageofboththePandAsitetRNAlysspeciesinthe-1direction.FrameshiftingrequiresanSD-likeelement10nucleotidesupstreamoftheslipperysequenceandastem-loopstructure5nucleotid
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