2025年大学《生物信息学》专业题库—— 基因组学与表观遗传学的关系.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——基因组学与表观遗传学的关系

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题

1.下列哪项技术主要用于检测基因组中DNA序列的变异？

A.RNA测序(RNA-Seq)

B.染色质免疫共沉淀(ChIP-Seq)

C.差异基因表达分析(DGE)

D.变异检测算法(如GATK)

2.DNA甲基化主要发生在基因组的什么位置？

A.组蛋白氨基酸侧链

B.DNA碱基对之间

C.RNA分子内部

D.核糖体上

3.乙酰化修饰通常与组蛋白的哪个赖氨酸残基相关，并倾向于促进基因表达？

A.赖氨酸4(K4)

B.赖氨酸9(K9)

C.丝氨酸6(S6)

D.苏氨酸3(T3)

4.RNA-Seq技术主要目的是什么？

A.测序基因组中的所有DNA修饰

B.测序特定区域的染色质可及性

C.定量测量细胞中不同RNA分子的丰度

D.测序整个细胞器的基因组

5.以下哪个过程是表观遗传调控的典型特征？

A.DNA序列的永久性改变

B.基因组的重排

C.在不改变DNA序列的情况下改变基因功能

D.线粒体DNA的丢失

6.ChIP-Seq技术通常用于研究什么？

A.基因组范围内的序列变异

B.DNA与蛋白质（如转录因子）的结合位点

C.RNA分子的表达水平和种类

D.DNA的甲基化水平

7.多组学研究的核心目标是什么？

A.仅分析一种分子层面的数据

B.将来自不同组学实验的数据整合起来，以获得更全面的生物学理解

C.重复单一组学的实验以验证结果

D.仅关注基因组序列信息

8.在生物信息学中，motiffinding工具通常应用于哪种数据？

A.DNA序列变异数据

B.RNA-Seq表达数据

C.ChIP-Seq数据，用于识别转录因子结合位点

D.DNA甲基化数据

9.整合基因表达数据和染色质可及性数据的主要目的是什么？

A.确定基因的物理位置

B.预测基因的启动子区域

C.识别潜在的调控区域和机制

D.比较不同物种的基因组大小

10.单细胞多组学技术的主要优势是什么？

A.可以分析整个生物体的表观遗传状态

B.能够区分不同细胞类型，研究细胞异质性

C.只能分析细胞核的基因组

D.大大降低了实验成本

二、填空题

1.表观遗传学研究的核心是______、DNA甲基化和染色质重塑。

2.RNA-Seq技术通过检测______分子的丰度来反映基因表达的调控状态。

3.组蛋白修饰可以通过改变染色质的______来影响基因的转录活性。

4.ChIP-Seq数据分析中的peakcalling步骤旨在识别DNA与蛋白质结合的______。

5.整合基因组学和表观遗传学数据时，一个常见的挑战是处理不同数据的______和______问题。

6.DNA甲基化通常与基因的______相关联，而H3K4me3则常与活跃的染色质和基因______相关。

7.生物信息学在表观遗传学研究中可用于分析表观遗传标记在基因组上的______和______。

8.除了表观遗传修饰外，基因组变异（如SNP）也显著影响基因表达和功能，多组学分析有助于研究______与表观遗传状态的相互作用。

9.基因组组装是许多下游生物信息学分析的基础步骤，对于分析表观遗传标记的______至关重要。

10.随着测序技术的发展，大规模、高分辨率的______和______数据成为表观遗传学研究的常用数据类型。

三、简答题

1.简述DNA甲基化在基因表达调控中的主要作用机制。

2.解释什么是表观遗传变异，并举例说明其与遗传变异的区别。

3.描述利用生物信息学方法分析整合ChIP-Seq和RNA-Seq数据的典型流程及其生物学意义。

四、分析题

假设一项研究旨在探索某基因在特定细胞类型中的表达调控机制。研究人员收集了该细胞类型的基因组DNA、总RNA以及使用特异性抗体进行的染色质免疫共沉淀(ChIP)数据（靶向RNA聚合酶II）。请简述生物信息学家可能如何利用这些数据，设计一个分析方案来推断该基因的调控区域、潜在的转录因子结合位点以及表观遗传标记（如H3K4me3和H3K27ac）如何影响其表达状态。

试卷答案

一、选择题