陆地棉RVT_3基因家族的全基因组分析.pdfVIP

第24卷第1期南通大学学报（自然科学版）Vol.24No.1

2025年3月JournalofNantongUniversity(NaturalScienceEdition)Mar.2025

doi:10.12194/j.ntu.20240108001

引文格式：谷海静，孙康泰，唐峻峰，等陆地棉RVT_3基因家族的全基因组分析[J].南通大学学报（自然科学版），2025，

24(1):66-73.

陆地棉RVT_3基因家族的全基因组分析

谷海静1，孙康泰1，唐峻峰1，吴浩1，高

高昕！，陈俊宇1，

李烨雄1，杨一轩²，汪保华1*

226001)

（1.南通大学生命科学学院，江苏南通226019;2.江苏省南通中学，江苏南通

摘要：土壤盐碱化导致的盐胁迫限制植物的生长发育，对农业生产具有极大挑战，严重限制了农业生产力的发展。

为实现由治理盐碱地适应作物向选育耐盐碱植物适应盐碱地转变，需要发掘有效的作物耐盐基因。RVT_3基因家

族属于逆转录转座子家族，其结构域普遍存在于植物中。前期基于陆地棉盐胁迫转录组分析发现该家族系列基因

与耐盐相关；在此基础上，借助PFam数据库对此家族进行生物信息学分析，从陆地棉的全基因组中筛选得到173

个基因。对这173个基因进行系统发育、基因结构、染色体定位、基因复制等方面的分析，同时对家族基因的顺式作

用元件进行了鉴定。染色体定位分析结果表明,RVT_3基因发生了许多片段复制事件；系统发育分析、基因结构分

析和保守基序分析表明，处于同一家族的基因具有相似的基因结构和相似的保守基序；顺式作用元件分析结果表

明,该基因家族可能参与各种生物和非生物胁迫响应。这些RVT_3蛋白被分为3个不同的亚家族；在不同亚组中

的不同基因有相似的基因结构证实了家族的分化方向;173个基因中有146个基因定位在陆地棉26条染色体上。

此外，通过RT-qPCR证实了该基因家族确实响应陆地棉盐胁迫。这些结果为阐明RVT_3基因家族的进化关系和

功能特征提供了有价值的信息，也为进一步探究棉花耐盐响应机制，从而服务于棉花耐盐分子育种奠定了基础。

关键词：陆地棉；RVT3；基因家族；盐胁迫；逆转录转座子

中图分类号：S562文献标志码：A

Genome-wideanalysisofRVT_3genefamilyinuplandcotton

GUHaijing,SUNKangtai,TANGJunfeng,WUYunhao,GAOXin,CHENJunyu,LIYexiong,

YANGYixuan’,WANGBaohual*

(1.SchoolofLifeSciences,NantongUniversity,Nantong226019,China;

2.NantongMiddleSchool,Nantong226001,China)

Abstract:Soilsalinizationinducessaltstress,whichrestrictsplantgrowthanddevelopment,presentingsignificantob-

staclestoagriculturalproductionandconstrainingproductivitygains.Toshiftfrommanagingsaline-