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STR/SSR/ STR/SSR/ SSTTRR//SSSSRR//微卫星分析 微卫星标记（Microsatellite）也称为短串联重复序列（STR）或简单重复序列（SSR），是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。微卫星位点通 常通过PCR 扩增，扩增产物通过电泳分析并根据大小分离等位基因进行检测。PCR扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测，传统采用聚丙烯酰胺电泳加放 射显影或银染的方法，费时费力效率低。我们利用ABI遗传分析仪对荧光标记DNA片段进行检测，加上分子量内标进行DNA片段长度计算，使STR分型变 得高效快捷，结果也更加精确。 服务项目： 1. 引物筛选 选取部分代表性样本，利用普通引物扩增这些样本，然后利用高分辨率的芯片电泳或PAGE 验证引物的特异性、扩增效率和基因座多态性等信息。 2. 样本批量扩增 用带有荧光标记（FAM/HEX/TMR等）的引物，对批量样本进行PCR扩增。 3. 测序仪检测 带有荧光标记的PCR产物进行稀释后与分子量内标、去离子甲酰胺混合，用3730等测序仪进行毛细管电泳，并得到原始数据（fsa文件）。 4. 数据分析 编制panel 和bin 等文件，使用正版GeneMapper 软件分析测序仪得到的fsa 文件，并生成PDF图谱和Excel文档（包含 size、基因分型等信息）。 5. 数据挖掘 利用生物信息学软件（POPGENE、MEGA、PHYLIP、ARLEQUIN等）对上述数据进行进一步分析，绘制遗传连锁图谱、分析连锁不平衡和分析多态性等。 服务流程： 引物合成（普通引物和荧光引物） ↓ 样品DNA提取 ↓ DNA定量 ↓ PCR预实验 ↓ 批量PCR扩增 ↓ 毛细管电泳预检测(ABI3730xlGeneticAnalyzer) ↓ 稀释后批量进行毛细管电泳检测 ↓ GeneMapperV3.2软件分析得到原始数据（fsa文件） ↓ 生成PDF图谱和Excel文档并进一步处理 检测平台： 岛津MultiNA 芯片电泳仪、ABI377测序仪、ABI3130 测序仪、ABI3730测序仪。 客户提供： 细胞、DNA、动植物各种组织材料、人类各种组织材料，引物信息，片段长度范围。 公司提供： 引物、微卫星分析的原始数据以及GeneMapper生成的PDF图谱、包含片段长度等信息的Excel文档和进一步的分析结果等。