大豆胞囊线虫不同虫态DNA提取方法及ITSrRNA扩增.pdf

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第36卷 第5期 植 物 保 护 学 报 Vo1.36 No.5 2009年 10 月 ACTA PHYTOPHYLACICA SINICA Oct. 2O09 大豆胞囊线虫不 同虫态 DNA提取方法及 ITSrRNA扩增 DNA extractionmethodsand ITSrRNA analysisfrom different growthstagesofHeteroderaglycine 郑雅楠 段玉玺 孙晶双 陈立杰 (沈阳农业大学植物保护学院,沈阳 110161) ZhengYanan DuanYuxi SunJingshuang ChenLijie (CollegeofPlantProtection,ShenyangAgriculturalUniversity,Shenyang 110161,LiaoningProvince,China) 大豆胞囊线虫病害是大豆胞囊线虫Heterodera DNA2txL。扩增条件为:94cC3min,94℃30S,50℃ glycinesIchinohe(soybeancystnematode,SCN)引起 30S,72℃ 1min,30个循环,72℃ 10min。 的大豆生产中的毁灭性病害。随着研究的深入,分 2 结果与分析 子生物学手段越来越多地应用于 SCN的各项研究 2.1不同方法提取 SCN不同虫态DNA 中,如分类鉴定 、种群遗传规律 及基因功能 ] 用试剂盒提取法和抽提法从J2、白色雌成虫和 等,而高质量的总 DNA及稳定的PCR反应体系是 褐色胞囊中制备的DNA均能够通过电泳检测得到 获取可靠 SCN基因片段的前提。 目前,已有较多关 相应的条带。通过琼脂糖 电泳检测DNA的提取质 于DNA提取技术的研究 J,但对不同方法进行比较 量,以条带整齐单一、清晰明亮为优。采用 WLB法 的报道较少。作者研究了不同方法获得的不同虫态 提取的DNA经电泳检测没有明显条带,抽提法提取 DNA质量和不 同 DNA模板对 PCR扩增产物 的 褐色胞囊 DNA质量优于试剂盒法。在 3种虫态中, 影响。 用雌成虫制备的DNA质量较 J2和褐色胞囊的好 1材料与方法 (图 1)。 1.1DNA提取 2.2 ITSrRNA 段确扩增 抽提法:将 2龄幼虫 (J2)、雌成虫和胞囊分别 采用不同方法从 3种虫态样品中均能制备得到 收集至 1.5mL离心管中,使干物质总体积达到0.1 长度约为 1kb的片段,与预扩增片段大小相 同。且 mL(至离心管0.1mL刻度线处)。用液氮反复冻融 条带均单一清晰。说明采用不同提取方法,从不同 后研磨至匀浆 。DNA提取参照Harmey等 的方法 虫态中提取的基因组 DNA,均能够作为PCR反应的 进行。WLB法:参照Williams等 的方法进行。试 模板进行基因片段扩增 (图2)。 剂盒提取法:使用细菌基因组试剂盒进行提取,方法 3讨论 详见说明书。 本研究结果表明,相 同方法提取 的基 因组 DNA 1.2 ITSrRNA 段 的 璃 中,以白色雌成虫的质量较好,而从褐色胞囊 中提取 通用引物为AB28 (ATATGCTFAAGTrCAGCG— 的DNA样品拖尾现象较严重,可能是由于胞囊皮中 GGT)和 TW81(GTI~CCGTAGGTGAACCTG

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