山羊心脏型脂肪酸结合蛋白cDNA序列克隆及生物信息学分析.pdfVIP

中国雇学c量握 2011，27(23)：17-20 ChineseAgriculturalScienceBulletin 山羊心脏型脂肪酸结合蛋白eDNA序列克隆 及生物信息学分析 王兰萍 ，耿荣庆 ，冀德君 ，常 洪。 (盐城师范学院生命科学与技术学院，江苏盐城 224051： 。扬州大学动物科学与技术学院，江苏扬州225009) 摘 要：通过RToPCR技术克隆山羊心脏型脂肪酸结合蛋白的cDNA全序列，并对cDNA序列的氨基酸同 源性、理化性质、二级结构特征进行了预测和分析。结果显示，山羊H-FABP基因cDNA全长402bp。推 测的氨基酸序列与绵羊同源性为100％；H．FABP蛋白属疏水性蛋白，呈弱酸性；．z-~L结构以B折叠为主； 不合跨膜结构域，具有潜在的信号肽位点、多个其他信号位点以及细胞脂肪酸结合信号位点，从而为揭 示H—FABP蛋 白空间结构和生物学功能研究提供理论基础。 关键词：山羊；心脏型脂肪酸结合蛋 白；克隆；序列分析 中图分类号：$827 文献标志码 ：A 论文编号：2011．0123 eDNA ClongingofHeartFattyAcidBindingProteinGenefrom GoatanditsBioinformaticAnalysis WangLanping，GengRongqing，JiDejun，ChangHong (Col／egeofLyleScienceandTechnology,YanchengTeachersUniversity，YanchengJiangsu224051； CollegeofAnimalScienceandTechnology,YangzhouUniversity，YangzhouJiangsu225009) Abstract：FulllengthcDNA sequenceofheartfattyacidbindingproteinfrom goatwasclonedbyRT-PCR technology．Theanalysisandpredictionon theaminosimilarity，physicochemicalpropertiesandsecondary structurecharacterwereconductedrfom acquired sequences．TheresultsshowedthatgoatH-FABP gene cDNA was402bpinlengthanditshomoloyg ratesofpredictedaminoacidsequencewas100％ tosheep． H-FABPbelongtohydrophilicandfaintlyacidprotein．Thesecondary sturcturewasmainlycomposedofp sheet．Ithadnotransmembranousregionsbutpossessedpotential signal peptide，several othersingal sitesand cellfattyacidbindingsite．Theseresultswouldprovidetheoreticalbaseforrevealing theprotein space sturctureandbiologicalfunction． Keywords：goat；heartfattyacidbindingprotein；cloning；sequenceanalysis 0 引言 表达 。】。肌 内脂肪含量(IMF)是衡量肉品质的一个重 脂 肪 酸 结 合 蛋 白 (fattyacidbindingprotein， 要指标，而H．FABP能够影响肌 内脂肪的含量，对 肉品 FABP)是一组低分子量胞液蛋白，广泛存在于动物心、 质具有重要作用