番茄bZIP基因家族的系统进化分析.pdfVIP

第45卷第9期 东 北 农 业 大 学 学 报 45(9)：47-55 2014年9月 JournalofNortheastA culturalUniversity September2014 网络出版时间2014—9—1810：41：33 U【RL]http：／／www．cnki．netk／ems／detail／23．1391．S1041．003．html 番茄bZIP基因家族的系统进化分析 张珍珠1,2,3 陈秀玲 ，王沛文 ，戚 飞 ，谢 莹 ，王傲雪 。4 (1．东北农业大学生命科学学院，哈尔滨 150030；2．齐齐哈尔大学化学与化学工程学院，黑龙江 齐齐哈尔 161006； 3．黑龙江省高校农业生物功能基因重点实验室，东北农业大学，哈尔滨 150030：4．东北农业大学园艺学院，哈尔滨 150030) 摘 要：bZIP基因家族是一类广泛存在于真核生物中的转录因子家族，参与多个植物生长发育及生物和非生 物胁迫的响应过程。目前，已对多个物种的bZIP基因家族进行信息学分析，而未见番茄中bZIP基因家族的分析报 道。通过番茄基因组数据库，鉴定和分析番茄bZIP转录因子家族，获得76个bZIP基因家族成员；根据系统进化、 基因结构和保守序列的分析将这些基因分成16个亚类；染色体分布和遗传分析揭示，番茄bZIP基因家族存在于12 条染色体上并主要以片段复制的方式进行扩增。研究结果为揭示番茄和其他物种的bZIP基因家族成员的功能奠定 理论基础 。 关键词 ：番茄；bZIP；生物信息学；系统进化；基因复制 中图分类号：$641．2；Q78 文献标志码 ：A 文章编号：1005—9369(2014)09—0047—09 张珍珠，陈秀玲，王沛文，等．番茄bZIP基因家族的系统进化分析[J】．东北农业大学学报，2014，45(9)：47-55． ZhangZhenzhu，ChenXiuling，WangPeiwen，eta1．PhyleticevolutionanalysisofbZIPfamilyintomatoJ[]．JournalofNodh— eastAgriculturalUniversity,2014，45(9)：47—55．(inChinesewithEnglishabstract) PhyleticevolutionanalysisofbZlPfamilyintomato／zHANGZhenzhu1~．CHEN Xiuling4，WANG Peiwen，QlFei，XIEYing4，WANGAoxue1l3(1．SchoolofLifeSciences，Northeast AgriculturalUniversity,Harbin 150030，China；2．SchooIofChemistry and ChemicaIEngineering。 QiqiharUniversiyt,QiqiharHeilongjiang161006，China；3．KeyLaboratoryofAgricultualBiological FunctionaIGenes，NortheastAgriculturalUniversiyt,Harbin150030，China；4．SchoolofHorticulture， NortheastAgriculturalUniversiyt,Harbin150030，China) Abstract：Basicregionleucinezipperproteins(bZP)familyisakindoftranscriptionalfactorand presentsinalleukaryotes，involvedinvariousprocessesofplantgrowthanddevelopmentandresponseto bioticandabioticstress．bZlPgenefamilyhavebeenreportedinafew speciesabou