Rules Governing Selective Protein Carbonylation 英文参考文献.docVIP

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2017-05-13 发布于上海
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Rules Governing Selective Protein Carbonylation 英文参考文献.doc

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RulesGoverningSelectiveProteinCarbonylation EtienneMaisonneuve1.,AdrienDucret1.,PierreKhoueiry1,SabrinaLignon2,SoniaLonghi3 ,Emmanuel Talla1*,SamDukan1* 1Laboratoire de Chimie Bacte′rienne – Aix Marseille Universite′ - UPR 9043-CNRS, 31, Chemin Joseph Aiguier, Marseille, France, 2Service de micro se′quenc?age et de spectrome′triedemasse–CNRS-31,CheminJosephAiguier,Marseille,France,3ArchitectureetFonctiondesMacromole′culesBiologiques,AixMarseilleUniversite′-CNRS, UMR6098,Marseille,France Abstract Background:Carbonylderivativesaremainlyformedbydirectmetal-catalysedoxidation(MCO)attacksontheamino-acidside chainsofproline,arginine,lysineandthreonineresidues.Forreasonsunknown,onlysomeproteinsarepronetocarbonylation. Methodology/Principal Findings: We used mass spectrometry analysis to identify carbonylated sites in: BSA that had undergoneinvitroMCO,and23carbonylatedproteinsinEscherichiacoli.Thepresenceofacarbonylatedsiterenderedthe neighbouringcarbonylatablesitemorepronetocarbonylation.Mostcarbonylatedsiteswerepresentwithinhotspotsof carbonylation.Theseobservationsledustosuggestrulesforidentifyingsitesmorepronetocarbonylation.Weusedthese rules to design an in silico model (available at rs-mrs.fr/CSPD/), allowing an effective and accurate predictionofsitesandofproteinsmorepronetocarbonylationintheE.coliproteome. Conclusions/Significance: Weobservedthatproteinsevolvetoeitherselectivelymaintainorlosepredictedhotspotsof carbonylation depending on their biological function. As our predictive model also allows efficient detection of carbonylatedproteinsinBacillussubtilis,webelievethatourmodelmaybeextendedtodirectMCOattacksinallorganisms. Citation: Maisonneuve E, Ducret A, Khoueiry P, Lignon S, Longhi S, et al. (2009) Rules Governing Selective Protein Carbonylation. PLoS ONE 4(10): e7269. doi:10.1371/journal.pone.0007269 Editor:AndreasHofmann,GriffithUniversity,Australia ReceivedJune29,2009;AcceptedJuly28,2009;PublishedOctober5,2009 Copyright:?2009Maisonneuveetal.Thisisanope