不同分娩方式婴儿肠道菌群对比分析-消化内科专业论文.docxVIP

万方数据 万方数据 解放军医学院博士学位论文 目 录 中文摘要………………………………………………………………………（1） 英文摘要………………………………………………………………………（2） 前 言………………………………………………………………………（3） 材料与方法……………………………………………………………………（4） 结 果………………………………………………………………………（10） 讨 论………………………………………………………………………（69） 综 述………………………………………………………………………（74） 发表文章………………………………………………………………………（82） 致 谢………………………………………………………………………（83） 解放军医学院博士学位论文 解放军医学院博士学位论文 英文缩略词表 Abbreviations 英文缩写 英文全称 中文全称 16S-rDNA 16S ribosomal DNA 16S 核糖体 DNA PCR Polymerase Chain Reaction 聚合酶链式反应 OTU operational taxonomic unit 操作分类单元 PcoA Principal Coordinate Analysis 主坐标分析 UPGMA unweighted Pair-Group Method with Arithmetic mean， 非加权组平均法 RDP Ribosomal-Database-Project 核糖体数据库项目 作 者：郭 贺 学科专业：内科学（消化内科） 导 师：杨云生 教授 ` 不同分娩方式婴儿肠道菌群对比分析 中文摘要 目的：对比分析不同分娩方式出生婴儿肠道菌群差异 方法：2012 年 4 月至 2012 年 11 月在解放军总医院产科纳入不同分娩方式（顺 产、剖宫产）的足月正常体重新生儿，收集胎粪及出生后 1 周、2 周、1 个月、2 个月、3 个月、6 个月和 1 岁时粪便标本冻存于-80oC 冰箱。跟踪随访婴儿喂养、 生长发育、肠道情况以及用药情况（抗生素及益生菌制剂）。提取粪便细菌基因 组 DNA 并扩增其 16S rDNA 的 V4 区，应用 Illumina Miseq PE 300 平台测序，分 析其肠道菌群结构。 结果：1.最终随访得到喂养方式为母乳和配方奶粉混合喂养、且出生后 1 年内均 未用过抗生素及益生菌制剂的婴儿共 21 例，其中剖宫产婴儿 15 例，顺产婴儿 6 例；2.胎粪中丰度最高的是变形菌门和硬壁菌门，其次是放线菌门和拟杆菌门， 菌群组成以类杆菌属、双歧杆菌属、梭菌属、栖粪杆菌属、链球菌属和韦荣球菌 属为主；3. 婴儿出生后 1 年内，顺产组粪便样本总体菌群多样性略高于剖宫产 组；顺产组粪便样本阿克曼菌属和瘤胃球菌属相对丰度高于剖宫产组；而剖宫产 组粪便样本中海杆菌属和肠球菌属相对丰度高于顺产组；此外许多菌具有组间特 异性，只出现于顺产组或只出现于剖宫产组；4.在顺产和剖宫产组各有几例婴儿 其不同时间的粪便样品可以通过 Unweighted unifrac 聚类分别各自聚合成一类。 结论：胎粪中细菌种类丰富，婴儿出生前肠道菌群已开始建立；顺产婴儿肠道菌 群多样性略高于剖宫产婴儿，两组婴儿肠道菌群存在差异；婴儿出生后肠道菌群 不同时间点比较存在一致性。 关键词：剖宫产术，正常分娩，婴儿，肠道菌群 1 Comparative analysis of fecal microbiota of full-term infants born with different methods of delivery Abstract Objective To analyze the fecal microbiota of full-term infants born with different methods of delivery. Methods The study included 21 infants, six of the infants were born vaginally and 15 by caesarean section(CS ) . Fecal samples were collected at 0(meconium), 1 ,2 weeks and 1, 2, 3, 6 ,12 months after birth and were stored at -80oC. The DNA of stool samples were extracted and amplification were performed targeting the variable