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猪OLR1基因多态性与肉质性状关联分析
猪OLR1基因多态性与肉质性状关联分析
摘要:为鉴定与猪的肉质性状有重要影响的分子标记,经克隆测序,鉴定出OLR1基因第5内含子存在C52T突变,通过PCR-PstⅠ-RFLP方法进行了基因型检测,分别计算了该SNP在大白猪、长白猪、梅山猪、大白×梅山F2代猪中的基因型频率和基因频率,并且对大白×梅山F2代猪的基因型与肉质相关性状进行了关联分析。结果表明,CC基因型的肩部膘厚、胸腰椎间膘厚、平均背膘极显著高于CT基因型个体(P0.01);CC基因型的皮率、瘦肉率、6-7腰椎间膘厚、花油重、臀部膘厚、背最长肌大理石纹、股二头肌大理石纹显著高于CT基因型(P0.05),C等位基因对猪的脂肪沉积具有正效应。
关键词:猪;OLR1;PCR-PstⅠ-RFLP;肉质性状;关联分析
中图分类号:S828 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2015)11-2686-04
DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2015.11.034
Association Analysis on Meat Quality Traits and Polymorphism in Porcine OLR1 Gene
GUO Mi-mi1,MEI Shu-qi2,QIAO-Mu2,WU Jun-jing2,ZHAO Kang2,CHENG Yao1,LI Zhu-nan1
(1. College of Animal Science, Yangtze University, Jingzhou 434025, Hubei, China;
2.Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Hubei Academy of Agricultural Science, Wuhan 430064, China)
Abstract: To identify DNA markers which have significant effect on pig meat quality traits, the single nucleotide polymorphism (SNP) and genotype were tested by sequencing and PCR-PstⅠ-RFLP method,respectively. The results showed that a SNP (C52T) was found in intron 5,then the gene and genotype frequency in the Large White, Landrace, Meishan,Large White×Meishan F2’s populations and the association analysis was performed in Large White×Meishan F2’s pigs were analyzed. The results showed that the fat thickness, thorax-waist fat thickness and average backfat thickness of CC genotype pigs were extremely significantly higher than that of CT genotype(P0.01); CC genotype pigs had significant higher skin percentage, lean meat percentage,6-7 rib fat thickness,dressing percentage, hip fat thickness, meat marbling of longissimus dorsi and meat marbling of biceps femoris than that of CT genotype(P0.05). The results also showed that C allele had positive effect on fat deposition of pigs.
Key words: pig; OLR1; PCR-PstⅠ-RFLP; meat quality traits; association analysis
OLR1基因是动脉粥样硬化的候选基因,主要氧化低密度脂蛋白(OxLDL)内皮细胞,调节动脉粥样硬化病变和参与一些细胞过程,影响动脉粥样硬化的发病机制[1]。OLR1基因对血管内皮细胞的损伤、参与动脉粥样硬
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