【分子诊断学】_2检验系基因组与蛋白质组.pptVIP

基因组与蛋白质组 病毒基因组 结构简单，基因组小，所含基因少。 基因组可由DNA组成，也可由RNA组成，但不能共存于同一病毒。 DNA病毒：多数为双链(ds)、环状或线性； RNA病毒：多数为单链(ss)、线性； 相关基因丛集。 DNA序列中功能相关的RNA和蛋白质基因，丛集在基因组的一个或几个特定部位，形成一个功能单位或转录单位，可被一起转录成为多顺反子mRNA。 常见重叠基因现象。 非编码区少，重复顺序少。 蛋白质组与蛋白质组学 蛋白质组（proteome） 指一个基因组表达的全部蛋白质及其存在方式 蛋白质组学（proteomics） 是对在不同时间和空间发挥功能的特定蛋白质群体的研究。旨在阐明生物体全部蛋白质的表达模式及功能模式。 蛋白质组学的主要研究技术 蛋白质分离技术 双向电泳(Two Dimensional Electrophoresis ， 2DE) 液相色谱（Liquid chromatography, LC) 蛋白质鉴定技术 基质辅助激光解析电离-飞行质谱 电喷雾质谱 串联质谱 蛋白质组学的主要研究技术 蛋白质芯片技术 表面增强激光解析电离-飞行时间质谱 酵母双杂交技术 定量蛋白质组学 双向荧光差异凝胶电泳（2D-DIGE) 细胞培养氨基酸稳定同位素标记（SILAC） 同位素亲和标记与同位素标记相对和绝对定量 （ICAT和iTRAQ） 蛋白质组学在医学研究的应用 疾病诊断 FDA获准的用于卵巢癌术前和术后的预后检测： 血标本中检测 5 个蛋白 - SELDI技术筛选出β2-微球蛋白、转铁蛋白、载脂蛋白A1、 甲状腺素运载蛋白 - CA125 检测能识别出额外的潜在恶性肿瘤患者，确定是否需要手术治疗，帮助病人和医护人员确定属于什么类型的手术 新药研发 RAPD（ random amplified polymorphism DNA，随机扩增多态性ＤＮＡ） 用单一引物做随机引物，则单一引物会结合在基因组ＤＮＡ的反向重复序列上，若在其之间的DNA遗传特性发生变化，PCR产物表现其差异性，经电泳分离后，就可检测出被扩增的ＤＮＡ多态性。 蛋白质组研究的基本技术路线 IL-2 IL-4 TNFa GmCSF Cytokine Capture/Sandwich * * 基因组(genome) 泛指一个有机生命体、病毒或细胞器的全部遗传物质；在真核生物，基因组是指一套染色体（单倍体）DNA与线粒体DNA。即物种全部遗传信息的总和。 物种遗传信息的“总词典” 控制发育的“总程序” 生物进化历史的“总档案” 一、基因组概念 单链环状DNA病毒 噬菌体phiX174 1977，Sanger 乙型肝炎病毒（HBV） 聚合酶 HBsAg HBcAg 开环部分双链DNA病毒 禽流感病毒(H5N1) avian influenza A virus 单链RNA病毒 8节段-ssRNA 血凝素（HA） 神经氨酸酶（N) 人类免疫缺陷病毒(HIV) （human Immunodeficiency virus ） 逆转录病毒（两条相同正链RNA病毒） 原核生物基因组 细菌染色体DNA 质粒DNA 以大肠杆菌（Escherichia coli）为例 基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组成。 其DNA是与蛋白质结合，不形成染色体结构，只是习惯上将之称为染色体。细菌染色体DNA在胞内形成一个致密区域，即类核（nucleoid），类核无核膜将之与胞浆分开。 功能相关的几个结构基因往往串联排列在一起组成操纵子结构，受上游共同的调控区控制。 原核生物基因组中基因密度非常高,结构基因是连续的多为单一拷贝。 原核生物基因组结构与功能的特点 结构基因无重叠现象，基因组中任何一段DNA不会用于编码2种蛋白质。 在原核生物基因组中含有编码同工酶的基因。 在不同原核生物基因组中GC含量变化很大。 原核生物基因组的非编码区内主要是调控序列。 细菌基因组中的可移动成分能产生转座现象。 除细菌染色体外，还有能自主复制的双链环状DNA分子，称为质粒。 大肠杆菌染色体DNA 由一条环状双链DNA分子组成， 通常只有一个DNA复制起点。 质粒DNA 质粒是存在于细菌染色体外的，具有自主复制能力的环状双链DNA分子；大小为几kb。 真核生物基因组 染色体DNA 线粒体DNA 真核生物基因组结构与功能特点 真核生物基因组的化学本质为DNA，多与蛋白质结合形成染色质，基本结构单位