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郜刚分子生物学教案
7.4.1 半乳糖操纵子(galactose operon)
结构基因包括3个:
异构酶(galE)
乳糖-磷酸尿嘧啶核苷转移酶(galT)半乳糖激酶(galK)。
这3个酶的作用是使半乳糖变成葡萄糖-1-磷酸。
半乳糖操纵子特征: 具有双启动子
猜想与意外:
从前面的Lac操纵子可以知道,葡萄糖是大肠杆菌优先利用的碳源来生长,似乎是:
有简单的糖,就不会利用复杂的糖。
用同样的思路去考虑半乳糖gal操纵子时,人们发现意外:
无论有没有葡萄糖, gal操纵子都能被诱导,而且 gal操纵子总有本底水平的组成型合成。
gal操纵子的特点:
① 它有两个启动子,其mRNA可从两个不同的起始点开始转录;
② 它有两个O区,一个在P区上游,另一个在结构基因galE内部。
gal操纵子P-O区中存在两个相距仅5bp的启动子,可以分别起始mRNA的合成。每个启动子拥有各自的RNA聚合酶结合位点S1和S2。
功能分析
P1功能:控制结构基因编码分解利用半乳糖的酶类,作为用于细菌生长的碳源;用量大,非必须,具有诱导性。
P2功能:控制结构基因利用半乳糖作为细胞壁合成的前提物质——尿苷二磷酸半乳糖;用量小,必须,是组成型。
如果只有一个依赖于cAMP-CRP的启动子P1,当培养基中有葡萄糖时,就不能合成异构酶,细胞壁就受到威胁;所以要有一个不依赖于cAMP-CRP的启动子(P2),
如果只有一个不依赖于cAMP-CRP的启动子(P2),那就意味着即使有葡萄糖存在,半乳糖操纵子也要充分表达,这就是一种浪费。所以需要有调节基因对这个启动子加以控制
由于启动子2是不依赖于cAMP-CAP的启动子,所以无论有没有葡萄糖的时候,cAMP-CAP无论能否合成,都不影响它的启动,因此启动子2总是保持一种本底水平的转录。为什么是“本底水平”,是因为阻遏蛋白的原因:半衰期?!
由于启动子1是依赖于cAMP-CAP的启动子,尽管半乳糖作为诱导物,解除了Gal O1的阻遏,但是仍然需要葡萄糖调节,因为cAMP-CAP的浓度取决于葡萄糖!
像Lac操纵子一样,通常Gal1操纵子是受到阻遏蛋白的阻遏,是关闭的。而半乳糖(诱导物)可以诱导阻遏蛋白,解除它的阻遏作用,按理说启动子1应该开放。
但是如果细胞中有葡萄糖存在,就算解除了阻遏作用,启动子1仍然是关闭的,因为有葡萄糖存在,细胞中的cAMP就是低浓度的,而启动子1是依赖于cAMP-CAP的,而这时cAMP-CAP的浓度很低,所以启动子1仍然关闭。其结果是什么呢?只有大肠杆菌消耗掉葡萄糖之后,才能合成cAMP,启动子1才能开放。这就是它的经济原则。【如果是参赛此处可以加入情感教育,以煽动人心】
因此只有在没有葡萄糖的时候,同时又有半乳糖的时候,启动子1才是开放的
为什么gal操纵子需要两个转录起始位点? (涉及半乳糖在细胞代谢中的双重功能)
半乳糖两个作用:
可以作为唯一碳源供细胞生长;
与之相关的物质--尿苷二磷酸半乳糖(UDPgal)是大肠杆菌细胞壁合成的前体。
而启动子也有两个:
galP1起始的转录——无内源葡萄糖、有外源半乳糖时进行,以保证碳源的供应。
galP2起始的转录——有内源葡萄糖、无外源半乳糖时进行,以保证细胞壁的合成需要。
?生理功能(可以理解为生物学意义?)
无论从必要性和经济性考虑,都要有一个不依赖于cAMP-CAP的启动子(s2) 进行本底水平的组成型合成,以及一个依赖于cAMP-CAP的启动子(s1),进行高水平的调节,这样既可以满足细胞最基本的需要(细胞壁),又可以满足在没有葡萄糖而有半乳糖时,细胞能够利用半乳糖进行生长。
进一步解释:
gal P2是不依赖于cAMP-CRP的,
相反: cAMP-CRP对gal P2还起到一种抑制作用,这是因为其与结合位点的结合,会影响到RNA聚合酶对gal P2的利用。
因此教材上(page257)认为:只有S2活性完全被抑制时,(S1)的调控作用才是有效的。
7.4.2 阿拉伯糖操纵子(arabinose operon)
araB基因、araA基因和araD, 形成一个基因簇,简写为araBAD
三个基因的表达受到ara操纵子中araC基因产物AraC蛋白的调控。C蛋白有三个结合位点O2、O1和 I 。
araC基因是araBAD的调节基因
AraC对AraBAD的负控制
Ara C结合到ara I 的时候,由于araBAD的启动子本身与ara I有部分重叠,另外还可以引起上游序列回折弯曲,使得AraC同时与O2结合,从而使CRP位点被占据,RNA聚合酶也不能结合到启动子上,araBAD基因不转录。同时由于占据了O1,也抑制了AraC的转录。其本质
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