分子诊断学:第16章 复杂性疾病的分子诊断.pptVIP

分子诊断学:第16章 复杂性疾病的分子诊断.ppt

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中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 4)BRCA1 BRCA1是乳腺癌易感基因1(breast cancer susceptibility gene type 1, BRCA1),是遗传性乳腺癌/卵巢癌综合症的易感基因.定位于17q12-13,含22个外显子,编码1863个氨基酸. BRCA1功能:基因转录调控,DNA损伤修复.失活引起基因组不稳定. BRCA1基因突变或杂和性丢失,导致其失活,常见于乳腺癌和卵巢癌. 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 5) p16INK4a p16INK4a 是INK4(inhibitor of CDK4 and CDK6)基因的一种蛋白产物,是一种细胞周期抑制蛋白(CKI) 功能:p16INK4a与cylinD1竞争结合G1期激酶CDK4/CDK6,抑制其对Rb蛋白的磷酸化,结合转录因子E2F-1,结果依赖E2F-1转录的基因不能转录,从而抑制DNA合成,阻止细胞分裂. 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * p16INK4a 胰腺癌,非小细胞肺癌,神经胶质细胞瘤,急性白血病,鼻咽癌常见p16INK4a基因纯合性缺失. 食管鳞癌,胆管癌常见p16INK4a基因突变. 大肠癌,乳腺癌常见p16INK4a基因启动子部位CpG岛高甲基化. 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 6)p21 p21是一种广泛细胞周期激酶抑制蛋白. 功能:p21与多种cylinD/CDK复合物结合,使其丧失磷酸激酶活性,使pRb不能磷酸化,从而使细胞周期停止在G1期;还与PCNA(细胞核增殖抗原)结合,抑制其与DNA聚合酶结合,抑制DNA合成. (1)依赖p53途径.DNA受损, p53上调,诱导p21表达上升. (2)非依赖p53途径.生长因子(EGF,FGF,PDGF等)通过细胞分裂素活化的蛋白激酶(MAPK)途径上调p21表达. 多数肿瘤见其表达异常(尤其黑色素瘤),未见其突变. 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 7) 其他抑癌基因WT1 1WT1:肾恶性胚胎瘤易感基因,负调控转录因子,常表现为杂合性丢失. 2DCC(deleted in colorectal cancer, DCC):结直肠癌缺失基因,其缺失与结直肠癌进展有关. 3PTEN:抑制肿瘤细胞酪氨酸激酶FAK活性,抑制肿瘤细胞生长.通常以杂和性缺失,基因突变,甲基化改变见于多种肿瘤(乳腺癌,卵巢癌,肺癌,肾癌,膀胱癌等) 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 3.表观遗传学的改变 表观遗传学:即不是指DNA质与量的改变,而是DNA修饰改变,如甲基化改变,乙酰化改变,小RNA(microRNA)调节. 很多抑癌基因的失活是甲基化表观遗传学改变和突变,缺失等遗传学改变联合作用的结果. 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 4.DNA损伤及其分子改变 1物理化学因素(紫外线,电离辐射,致癌物). 2DNA分子自发改变发生于DNA复制,DNA修复,基因重排过程中,DNA分子自身的化学改变而导致的水解,氧化和甲基化. 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 5.基因组不稳定性 正常基因组保持惊人的稳定性和完整性,反映高保真复制 基因突变积累到一定程度,造成染色体畸变,从而造成染色体不稳定. 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 6.染色体异常 染色体的结构的改变 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 染色体数目的改变 1)整倍体 多倍体; 具有两套以上的染色体 三倍体:具有三套染色体 2)非整倍体:增加或减少一条或几条染色体 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 7 微卫星不稳定性 微卫星DNA指简单重复序列(1-4bp),在体内是不能表达的。原位杂交实验表明,卫星DNA定位于染色体的异染色质区,与染色体着丝点相连。 肿瘤表现为简单重复序列的增加或丢失. 结肠癌,胃癌,肺癌,胰腺癌 PCR检测 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 二、肿瘤早期分子诊断及预后 1.肺癌: (1)基因点突变:Rb, p53,K-ras,N-ras,APC (2)抑癌基因启动子甲基化:p16, APC, CDKN2 (3)杂合性缺失(LOH)(8p21-23,9p21) (4)基因异常扩增及染色体异常:c-erbB1扩 增,染色体多倍体和异倍体. (5)端粒酶 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 2结直肠癌 (1)点突变:K-ras(粪便) (2)CD44v6和 CD44v10 mRNA(粪便) (3)抑癌基因APC, p53, DCC突变 中山大学肿瘤防治中心 刘万里 * 3乳腺癌 (1)BRCA1,BRCA2基因突变:家族性乳腺 癌患者. (2)抑癌基因:p53,PTEN突变 (3 )癌基因:c-erbB2,c-myc(扩增), nm23(肿瘤转移抑制基因

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