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核苷酸(OD260)
核苷酸的生物功能
1.作为核酸合成的前体,其中NTP和dNTP分别是RNA和DNA合成的前体
2.充当能量货币,驱动细胞内各种反应
ATP
细胞通用的能量货币
UTP
糖原合成(UDP-葡糖糖)
CTP
磷脂合成
GTP
蛋白质合成
3.参与细胞的信号转导。第二信使
4.作为其他物质的前体或辅酶的成分。ADP为辅酶Ⅰ和Ⅱ的组成成分
5.转变成一些特殊的活化中间物。
6.作为某些酶的别构效应物参与代谢的调节
7.调节基因的表达
DNA的二级结构
1.DNA由两条反平行的多聚脱氧核糖核苷酸组成,两条链相互缠绕,形成右手螺旋
2.组成右手螺旋的两条链在碱基序列上是互补的,他们通过特殊的碱基对结合在一起。
3.碱基对位于双螺旋的内部,并垂直于螺旋轴,而磷酸脱氧核糖骨架则位于螺旋表面。碱基对之间通过疏水键和范德华力垛叠在一起(另一种为氢键),对双螺旋的稳定起重要作用。
4.双螺旋表面是不规则的有明显的大小沟
5.双螺旋的其他参数包括:相邻碱基对距离为0.33nm,相差约36°。螺旋的直径为2nm,螺旋距为3.32nm,每一圈完整的螺旋含有10个碱基对。然而细胞内的DNA螺旋每一圈实际含有10.4-10.6bp
引起DNA螺旋构象改变的主要因素有①相对湿度②盐的种类和浓度③碱基的组成和序列④超螺旋的数量和方向
促进形成A型螺旋的主要因素是相对湿度和降低和盐浓度的上升
B与A相比更宽,更平,更短。
RNA
二级结构
RNA的二级结构的多样性可以和蛋白质相提并论。RNA通常子午折叠,使得不同区段的互补序列之间形成局部的A型螺旋,而不能配对的序列以突起,简单环,内部环或发卡环的形式游离在双螺旋之外,形成多种形式的二级结构。
tRNA的二级结构
4个环 D环 反密码子环 可变环 TC 环
4个茎 受体茎 D茎 反密码子茎 TC茎
臂 D臂 反密码子臂 TC臂
核酸的化学性质
DNA在一定盐浓度下,水相中的DNA可被2.5-3倍体积的无水乙醇沉淀。RNA可以用异丙醇
变性
1.导致核酸变性的因素
凡是能破坏稳定双螺旋构象的因素,以及增强不利于双螺旋稳定的因素(如磷酸基的静电斥力和碱基分子的内能)都可以成为变性原因)
常用的DNA变性方法主要是热变性和碱变性
2.变性引起的核酸理化性质的改变
①核酸变性时,紫外线吸收增加。此现象称为增色效应。
②变性还可以增加DNA的浮力密度,这是因为变性后的DNA会像单链的RNA一样,通过链内的互补碱基对形成更加致密的结构
③变性还能降低DNA的粘度
④生物活性不一定破坏。如果功能直接由高级结构决定的RNA。如TRNA RRNA和核酶,一旦发生变性生物活性就会失去。
DNA的TM值
①DNA的均一性
②GC含量
③离子强度
④双螺旋长度
影响DNA复性
①温度
②DNA浓度
③离子强度
④DNA复杂程度
核酸一级结构的测定
1.第一代测序
①双脱氧法
②碱基特异性化学断裂法
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