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《生物信息学导论》课程教学大纲 Introduction to Bioinformatics 课程编号：170309005 学时：16 （理论16）学分：1 适用对象：医学信息工程专业,软件工程专业 先修课程：无 一、课程的性质和任务 该课程可以支撑毕业要求第 2.4.6.7.12 条的达成。 本课程主要介绍生物信息学数据的管理方法和分析技术。以常用生物信息学数据库为例介 绍序列数据.结构化数据及生物学知识的存储和管理方法；以现有的生物信息学分析工具为例， 介绍序列数据搜索与比对技术.蛋白质/基因二级结构，三级结构预测技术.蛋白质/基因互作用网 络建模技术及网络查询技术。目的是通过课程的学习，使得学生能够掌握基本的生物信息学知 识，提高学生运用所学知识解决实际问题的能力。 二、教学目的与要求 《生物信息学导论》是医学信息工程专业的一门专业必修课，本课程的教学目的要求在于 向医学信息工程专业学生介绍简明的生物信息学知识，使得学生了解生物信息学这个领域的最 基本的知识，掌握基本的解决问题的能力；掌握生物信息学中序列数据.结构化数据及基本分子 生物学知识，了解序列数据的搜索及对比技术.蛋白质/基因二级/三级结构预测技术.蛋白质/基因 相互作用网路络建模及其查询技术。 三、教学内容 第一章：生物信息学简介 1.教学内容 生物信息学的基本概念；生物信息学的研究对象.发展历史及研究意义；基本的生物学知识。 2.教学基本要求 了解生物信息学的基本概念；生物信息学的研究对象.发展历史及研究意义，掌握基本的生 物学知识。 3. 教学重点难点： 重点：生物信息学的基本概念；生物信息学的研究对象；基本生物学知识。 难点：基本生物学知识 4.教学建议： 342 利用学生容易理解的实例带领学生进入学科知识的领域。 第二章：生物数据管理技术 1.教学内容 蛋白质/基因序列数据库；蛋白质/基因结构数据库；蛋白质/基因知识库。 2.教学基本要求 了解蛋白质/基因序列数据库；蛋白质/基因结构数据库。了解蛋白质/基因知识库。 3. 教学重点难点： 蛋白质/基因序列数据库，蛋白质/基因结构数据库，蛋白质/基因知识库中的数据结构以及数 据查询。 4.教学建议： 实例教学，讲解已有的蛋白质数据所有的内容和特点。 第三章：序列分析技术 1.教学内容 序列分析的数学模型；序列数据搜索；序列比对；多序列比对。 2.教学基本要求 了解序列分析中所用到的数学模型，掌握从序列数据库中获取序列的方法，掌握序列比对算法。 了 解多序列比对 3. 教学重点难点： 序列分析的数学模型；序列比对算法。 4.教学建议： 实例教学，通过实例来分析序列的数学模型，以及序列比对算法。 第四章：结构预测技术 1.教学内容 结构预测的数学模型；DNA/RNA 二级结构预测；蛋白质二级结构预测；蛋白质三级结构预 测。 2.教学基本要求 了解结构预测的数学模型;掌握 DNA/RNA 二级结构预测;了解蛋白质二/三级结构预测。 3. 教学重点难点： 结构预测的数学模型，DNA/RNA 二级结构预测。 4.教学建议： 343 通过案例讲解结构预测的数学模型以及 DNA/RNA 二级结构预测。 第五章：互作用网络建模技术 1.教学内容 基因相互作用网络建模；基因调控网络建模；蛋白质相互作用网络建模。 2.教学基本要求 了解基因相互作用网络建模；基因调控网络建模；蛋白质相互作用网络建模。 3. 教学重点难点： 基因调控网络建模；蛋白质相互作用网络建模。 4.教学建议： 通过综述现有的基因互作用网络建模和蛋白质互作用网络建模的方法来使得学生对基因互 作用网络建模，基因调控网络和蛋白质互作用网络建模得到方法有所了解。 第六章：相互作用网