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复杂性状的遗传分析策略 0 rna表现型的自然法络和遗传基础的研究面临的挑战 建立不同的研究方法和方法，研究基因功能已成为当前遗传领域的主要研究内容。随着生物技术的进步,特别是近10年来人类以及其它模式生物基因组计划的开展,现代生物学的各个分支领域迅速发展。这些研究促使人们不断深入地了解遗传变异的本质,为农业发展和人类健康奠定了良好的研究基础。然而,要彻底了解复杂表型变异的遗传基础,阐明基因→RNA→蛋白质→表现型这一自然法则,仍然是当前面临的一个巨大挑战。目前,研究人员面对的不再是简单的孟德尔性状,而是一些有着复杂遗传结构、且有非遗传因素共同决定的复杂性状。那么什么是复杂性状?如何研究其遗传机制?有何实际意义?本文对此作一综述,并提出一些展望。 1 复杂性状的遗传基础研究和应用 复杂性状泛指由多基因和非遗传因素共同作用的一类性状。有别于传统的数量性状侧重于从表型分布加以描述,复杂性状则侧重于从遗传基础的角度阐述某一性状的遗传特征,因此,复杂性状涵盖范围更广。概括来说,主要包括:(1)经典的数量性状,即表型呈连续性分布的一类性状,如家禽的寿命、出生的体重、奶牛的产奶量、水稻的千粒重、棉花的纤维长度等。(2)表型间断分布的性状,主要指人类复杂疾病和动植物复杂抗性性状,如精神分裂、高血压、糖尿病、骨质疏松、心脏病、糖尿病、奶牛乳房炎抗性性状、植物抗病性状等,这类性状有的是存在着潜在的连续性分布,但在表现型上呈现间断分布;有的虽然可能是由单基因控制,但由于受到其它遗传或非遗传因素的干扰,其遗传机制相当复杂。比如,植物复杂抗性性状受到光照、水分或湿度等环境条件的作用;人类复杂疾病也受到所生存的环境,个人的不良习惯,性格和心情等非遗传因素的影响。(3)其它复杂性状,如行为、心理等难以准确度量的性状。这类性状首先尚缺乏科学合理的鉴定体系,往往是基于经验来进行判定;其次,对这类性状背后复杂的遗传和非遗传因素的研究也没有通行的研究手段和技术。 复杂性状之所以复杂,可能归结为以下几个原因:(1)上位性在复杂性状的遗传表达中起重要作用。已有证据表明,基因间的上位性可能是物种分化和适应的重要遗传机制。同时,在主要模式生物水稻,拟南芥和酵母上的研究已经表明[3~7],上位性也是杂种优势形成和复杂性状遗传表达的主要遗传学组分。基因间的这种上位性作用通过复杂的表达代谢等生理生化途径使得基因型和表现型的简单的对应关系发生偏移,从而使得发现和鉴别这些基因更加困难。(2)从基因到表型调节控制的多层次性。基因以线状排布于染色体,这种看似简单的一维结构却产生有着复杂构造的生命体。从基因到表型必然有着复杂的调控层次。(3)非遗传因素的作用。主要指个体所在环境条件的影响。基因有赖于一定的环境来产生一系列的表型变异。这些环境条件均影响基因的时空表达特异性。由此可见,表型的控制似乎以遗传的程序性和规则性以及非遗传的可变性和无序性为特征,这些特征决定了该类性状的复杂性。 复杂性状研究至今已有100多年,但是,早前的研究只是一种“黑箱”的结果,几乎没有涉及复杂性状的遗传基础,如一个复杂性状受哪些基因控制?它们位于何处?如何发生作用?等等。从20世纪80年代至今,分子生物学的不断进步推动了复杂性状遗传基础研究的迅速发展,其后发展的一系列生物技术手段以及统计分析方法为解析复杂性状的遗传结构提供了技术支持。近年来,动植物复杂性状遗传基础研究主要针对重要经济性状。2006年,中国启动了“973”计划,对家养动物复杂性状形成的遗传机制进行研究,以阐明调控性状表型的分子遗传基础。同年,国家“863”计划也立项以重点解析动植物重要性状形成的基因网络。在人类上,复杂疾病研究成为关注的热点[9~13],其主要目标在于为人类疾病的预防、诊断、治疗和研制新型药物奠定理论基础。2002年,美国孟斐斯大学的科学家们组织成立了复杂性状协会并召开了第一届会议,主要讨论动物及人类复杂性状的遗传基础研究。此后,该协会每年定期召开会议,研讨复杂性状的遗传机制。到目前为止,遗传基础研究清楚的人类孟德尔性状已超过1 500种,而所有研究清楚的复杂性状仍仅有几十种。因此复杂性状研究仍有很大的发展空间,必将成为今后遗传学研究的热点。 2 多区间描述方法 复杂性状的遗传基础虽早已有讨论,但遗传机制了解清楚的复杂性状仍为数不多。其根本原因既在于其复杂的遗传本质,也在于目前尚缺乏有效的研究策略,包括遗传资源开发、试验技术手段和统计分析方法。随着人类基因组计划、水稻基因组计划以及其它模式生物基因组计划的开展,大量分子标记被开发出来,由此可将数量性状基因标定在染色体上的某一位置。从20世纪末到现在,复杂性状的遗传基础研究主要是QTL分析,包括构建QTL图谱,分析QTL效应以及研究QTL的作用特征等方面。 构建QTL图谱就是根据