玉米产量相关性状QTL通用图谱的构建及功能候选基因的开发.pdfVIP

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2017-09-12 发布于湖北
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玉米产量相关性状QTL通用图谱的构建及功能候选基因的开发.pdf

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A C T n n6RIGULTURAE 华北农学报 ·2008，23(6)：20．27 BOREOLI—SIHICa 玉米产量相关性状 QTL通用图谱的构建及功能候选基因的开发张耿，祝丽英，陈景堂 (1．河北农业大学农学院，河北保定 071001；2．浙江大学农业与生物技术学院，浙江杭州 310029) 摘要：通过生物信息学手段，收集整理玉米基因组数据库中产量相关性状的QTL信息，借助高密度玉米遗传连锁图谱 IBM2005Neighbors和临近分子标记，建立了涵盖干物质和淀粉产量、籽粒相关性状、粒重相关性状以及穗部相关性状四大类共计 18个指标的QTL通用图谱。并将位于 QTL分布密集区域的基因，与水稻基因序列进行比对，找到了与水稻木质素合成有关的 2具有高同源性的基因AYl09876，同时改进了利用生物信息学手段筛选功能候选基因的路线图。关键词：玉米；生物信息学；产量性状；QTL；一致性图谱中图分类号：Q945 文献标识码：A 文章编号：1000—7091(2oo8)o6—0020—08 ConsensusMapoftheQTLsRelevanttoYieldTraitsofMaizeandthe DevelopmentofFunctionalCandidateGene ZHANGGeng一，ZHU Li—ying，CHENJing—tang (1·Coilege。fAgronomy，AgriculturalUniversity。fHebei，Ba。di“g 07l001，china； 2．CollegeofAgricultureandBiotechnology，ZhejiangUniversity，Hangzhou 310029，China) Abstract：TheinformationofQTLsrelevanttoyieldtraitinthedatabaseaboutmaize(ZeamaysL．)werecollected throughbioinformaticstools，andtheconsensusmapwasconstructedwiththeaidofhigh—densitygeneticlinkagemapIBM 2005NeighborsandtheadjacentmolecularmarkerstoeachQTL．Theconsensusmapcoveredatotalof18indicatorsin- volvingfourcategoriestraitssuchasdrymatterandstarchyield，grain—relatedtraits，seedweightaswellasear-related traits．WealsocomparedthegenesdistributedinQTLdenselycoveredareawiththesequenceofgenesinrice(Oryza sativaL．)bythemeansofBLAST，andsearchedageneAY109876whichhashighhomologywithgh2，agenerelated withthesynthesisofligninofrice．Therouteoffiltratefunctionalcandidategenebybioinfomr aticstoolshasbeen im— proved to()．． Keywords：Maize(ZeamaysL．)；Bioinformaties；Yieldtrait；QTL；Consensusmap 玉米产量相关性状研究的重要性不言而喻，在对数量性状的主效基因进行定位克隆，从而实现对育种过程中，针对与产量相关度较高的性状进行选 QTL的遗传操作，如 Frary等_l已经鉴定和克隆出影择，可以有效的提高育种效率。产量相关性状均为响番茄果实大小和形状的QTL。