向合成细胞迈进细胞与计算机复制过程中的遗传问题.pdfVIP

向合成细胞迈进：细胞与计算机复制过程中的遗传问题 唐善·安东 法国巴斯德研究所 摘要：对生命机制的理解预示着人类总有一天能重建细胞。对于生命表征的深入分析显示，细胞的分裂、繁 殖与计算机间的复制非常相似。这要求我们在亚细胞水平上进行分析比较。首先，细胞必须被看作是一个独 立于其遗传物质的机器。在此意义上，遗传物质在数代间复制，而机器也可以再生。繁殖是一个可以在子代 问累积有用信息的过程，从大量无用的信息海洋中提取有用信息是一个依赖能量的过程，并借助能量阻止功 能性实体的降解。细菌基因组的分析显示，核心基因(即维持必需功能的基因)负责执行这种类似于棘齿运 行的信息累积过程。本文提出，磷酸化矿物盐类可能是广泛的能量来源。 关键词：合成细胞；繁殖与复制；信息 合成生物学的目的是遵循遗传学法则，尝试重 2部分将会详细描述。 建细胞或生命。这一过程根本的理论基础是细胞被 我们也需要理解信息的本质，比较基因组学和 看作某种简单的机器，它们被建造的法则与那些工 神经生物学的研究成果能很好地诠释信息是一种实 程学的法则非常相似。但是机器之间是不能相互复 体，它可以在概念上等同物质、能量、时间和空间。 制的，这就需要我们从更深层次去理解生命过程，并 生命体被建造，也正是作为信息的载体和体现。 且为工程学法则在细胞建造上的运用寻找合理的依 1信息概念的重新理解 据。很明显，生命体的复制不是一个简单的拷贝过 程，我们可以也必须把这一过程分成两个独立的事 从爱因斯坦需要借助存在的“隐藏的变量”阐 件：即细胞实体的繁殖与遗传信息的复制。繁殖体 述量子世界起，物理学家们知道，以人们所熟悉的物 现的是一个抽象的概念，包括细胞成分和生命个体 质、能量、时间、空间等名词去诠释物质的现实世界， 在时间和空间上的关系；复制则是遗传信息的准确 有着天然的障碍。同样，当我们把信息放在生物学 拷贝。 中去解读时，以我们现在对信息这个名词的理解是 许多学者选择性地使用繁殖和复制这两个名 远远不够的。当然，限于本文的篇幅，不可能重新发 词，似乎它们之间可以随意替换，事实上不然。复制 展一个全新的数学模式去描述它，但应该意识到，信 必须尽可能在各代间产生完全相同的分子，这带来 息确实是与物质、能量、时间和空间等并列的物质实 不可逆转的累积错误；如果没有与外来DNA的重组 体。本文将集中描述信息的两个重要特征以及它与 与交换，错误信息或噪音最终会侵蚀DNA并带来毁 物质、能量和时间的关系。 灭性后果。繁殖不仅不会导致削减或毁灭，相反会 第1个对信息的概念进行数学式定量描述的是 Claude 使个体随时间进化。简单地说，繁殖能累积有用的 Shannon，他所建立的通信理论集中在测试字 信息，然而复制过程产生的多数信息都是无用的，甚 符串的完整性是否保留，而不是去解释这些字符串 至是噪音。 的含义。在生物学的范畴里，这与DNA的复制过程 对于生命体所发生的繁殖和复制过程，繁殖与 相似，但与我们想讨论的信息相差甚远，特别是与信 细胞器活动密切相关，而复制通常指的是染色体。 息在翻译和转录水平上的应用方式相差甚巨。 详细描述细胞机器非常困难，因为我们缺乏对细胞 内科医生HenryQuastler尝试进行医学和物理 组成形式的了解(即使是原核细胞，其细胞器组成 学结合的研究，他南探讨生命起源之谜开始，建立了 也不仅仅是一个微小试管里的反应体系)。幸运的 生命体组成的理论，并且该理论得到Dyson的进一 是，近年在原核细胞染色体基因组成上的大量进展 步发展。正如他们所提到的，本人也将重点强调，信 为我们探寻这种细胞机器组成提供