玉米骨干亲本及其衍生系中基因序列变异及与株高等性状关联分析.docVIP

玉米骨干亲本及其衍生系中基因序列变异及与株高等性状关联分析 　　摘要：玉米[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]基因是显性矮化基因，由于其突变体在DELLA区的碱基缺失而使其呈组成型表达抑制GA响应，从而表现出植株矮小，种子发芽率低，叶片呈暗绿色等特性。对玉米[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]基因在来源广泛的96份玉米自交系中进行了目标序列重测序，并与株高和穗位高2个株型性状以及穗长、穗粗、轴粗、穗质量、行粒数、穗行数和粒质量7个穗部性状进行关联分析。[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]基因在供试玉米自交系中共有66个变异位点，包括18个SNP和48个InDel。在编码区发现24个变异位点，包括6个SNP和18个InDel位点。关联分析发现，玉米[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]基因中1个非同义突变位点与株高显著关联，另外1个非同义突变位点与穗长显著关联。 　　关键词：玉米；骨干亲本基因；株高；关联分析 　　中图分类号： S513.03文献标志码： 　　赤霉素是植物重要的生长调控因子[1]，其最主要的功能就是控制茎的伸长生长。大量矮秆基因的研究结果表明，株高与赤霉素生物合成和赤霉素信号转导途径相关。 　　GA信号传导途径中基因突变时，部分持续对GA响应的突变体表现为徒长，植株纤细并且?~片灰绿，这和施加过量GA的植株表型一样；而无法对GA响应的突变体表现为叶片深绿、植株矮化、育性降低等，这与GA突变体合成受阻的表型相同，并且不可以通过外源施加GA得以恢复[2-3]。在植物体中，DELLA蛋白质是GA响应的最主要抑制因子，而GA传导途径的开启主要是通过解除这种抑制作用得以实现。DELLA蛋白质在N端的DELLA结构域中有2个保守元件：DELLA和VHYNP，这2个元件的DELLA类蛋白能够抑制对赤霉素的响应。本研究中的玉米[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]基因，其3个突变体[WTBX][STBX]d8-1、d8-2023[WTBZ][STBZ]和[WTBX][STBX]d8-Mp1[WTBZ][STBZ]在DELLA区、VHYNP区且2个区域同时缺失氨基酸导致植株呈明显矮化[4]。这些表明，[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]基因通过在GA转导途径抑制GA响应，来达到调控株高的目的。 　　玉米是世界三大粮食作物之一，也是集粮、饲、经“三元一体”的优势作物。2003年我国科学家率先提出了农作物“骨干亲本”的概念。此后，很多研究者利用分子标记技术，对玉米、小麦、大麦等作物的一些骨干亲本进行了分析，认为深入研究并充分利用骨干亲本有助于育种效率的显著提高。在我国的玉米生产中骨干亲本主要有黄早四、MO17、掖478、丹340、自330这5个骨干亲本，在育种中发挥了很重要的作用[5]。此外，作物的株高与抗倒性、产量等性状紧密相关，是重要农艺性状之一。目前，矮秆作物在生产上已经显示了巨大的增产潜力，矮秆基因的发掘及遗传研究利用在育种中越来越受重视。在玉米中，已经有大量的矮秆突变体被发现，其中玉米[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]是一种对外源GA响应并发生改变的矮化突变体。研究表明，玉米[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]突变体是由于[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]基因的DELLA结构域有碱基的缺失和突变，从而导致了矮秆的突变表型[6]。因此，[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]基因与株高的关联分析研究十分重要。此前，Thornsberry等首次运用了基于候选基因关联分析的方法研究了玉米的[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]基因，发现[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]基因中有9个多态性位点与玉米开花期的变化显著相关[4]；Camus-Kulandaivelu 等选用不同的玉米自交系也得出相同结论[7]。Andersen等用另一玉米自交系群体试验证明玉米[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]基因序列多样性与开花期和株高有关[8]。本研究选用来源广泛的96份玉米自交系（包括5大骨干亲本及其衍生系及糯玉米自交系）作为试验对象，在对目标基因测序的基础上，结合株高性状的测定结果，利用候选基因的关联分析方法，解析自然变异群体中[WTBX][STBX]Dwarf8[WTBZ][STBZ]基因的序列变异对株高等性状的作用及其影响，从而筛选出一些重要的变异位点以及优异位点组合，为我国玉米骨干自交系优良基因的有效利用和玉米优质育种提供