临床医学中生物信息学技术的运用.docVIP

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临床医学中生物信息学技术的运用 文档信息 : 文档作为关于“医学心理学”中“基础医学”的参考范文,为解决如何写好实用应用文、正确编写文案格式、内容素材摘取等相关工作提供支持。正文6282字,doc格式,可编辑。质优实惠,欢迎下载! 目录 TOC \o 1-9 \h \z \u 目录 1 正文 1 文1:临床医学中生物信息学技术的运用 1 1.疾病相关基因的发现: 2 2.新的药物分子靶点的发现和确立: 4 3.药物设计: 5 4.基因芯片: 6 总结与展望 7 文2:中药研究中生物技术的运用 8 参考文摘引言: 10 原创性声明(模板) 10 文章致谢(模板) 11 正文 临床医学中生物信息学技术的运用 文1:临床医学中生物信息学技术的运用 1995年, Fleischmann等[1]将一种全新的随机全基因组测序的策略应用于读取流感嗜血杆菌全基因组序列。这是人类第一次对自由活体微生物的全基因组测序。自从流感嗜血杆菌全基因组数据发表以来, 60多种微生物的全基因组序列被破译。据统计, 生物学信息正以每14个月翻一倍的速度增长。随着基因组及蛋白质序列数据库的快速增长, 以及从这些序列中获取最大信息的需求, 生物信息学 (bioinformatics) 作为一门独立学科应运而生。简而言之, 生物信息学就是利用计算和分析工具去收集、解释生物学数据的学科。生物信息学是一门综合学科, 是计算机科学、数学、物理、生物学的结合。生物信息学对于管理现代生物学和医学数据具有重大意义, 其研究成果将对人类社会和经济产生巨大推动作用。 生物信息学的基础是各种数据库的建立和分析工具的发展。 数据库 迄今为止, 生物学数据库总数已达500个以上。归纳起来可分为4大类:即基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构数据库、生物大分子三维空间结构数据库, 以及以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二级数据库。基因组数据库包括人类基因组数据库GDB及线虫基因组数据库AceDB;在核酸序列方面主要有GeneBank、EMBL和DDBJ;在蛋白质一级结构方面有SWISS-PROT、PIR和MIPS;在蛋白质的其他生物大分子的结构方面有PDB;在蛋白质结构分类方面有SCOP和CATH;二级数据库有蛋白质序列二次数据库Prosite、结构数据库DSSP等。 生物信息学在临床医学上的应用 1.疾病相关基因的发现: 很多疾病的发生与基因突变或基因多态性有关。有学者估计与癌症相关的原癌基因约有1 000个, 抑癌基因约有100个。约有6 000种以上的人类疾患与各种人类基因的变化相关联。更多的疾病是环境 (包括致病微生物) 与人类基因 (或基因产物) 相互作用的结果。随着人类基因组计划的深入研究, 当明确了人类全部基因在染色体上的位置、它们的序列特征[ (包括单核苷酸多态性 (single-nucleotide polymorphisms, SNPs) ]以及它们的表达规律和产物 ( RNA和蛋白质) 特征以后, 人们就可以有效地了解各种疾病发生的分子机制, 进而发展适宜的诊断和治疗手段。 发现新基因是当前国际上基因组研究的热点, 使用生物信息学的方法是发现新基因的重要手段。目前发现新基因的主要方法有多种: (1) 基因的电脑克隆:所谓基因的“电脑克隆”, 就是以计算机和互联网为手段, 发展新算法, 对公用、商用或自有数据库中存储的表达序列标签 (express sequence tags, EST) 进行修正、聚类、拼接和组装, 获得完整的基因序列, 以期发现新基因。最近Sang等[2]筛查cDNA文库, 分离了几个相关但不同的编码新结构蛋白 (novel structrue protei, P) 的cDNA克隆, 分析发现, 这些cDNA和公共数据库里的一些相似的EST来源于一种含17个外显子、核苷酸跨度227kb的单一基因, 该基因位于染色体位点, 主要导致有肿瘤倾向的Birt-Hogg-Dube综合征。Liang等[3]采用基因电脑克隆方法, 利用鼠视网膜数据库RetinalExpress, 将27 765个从公共cDNA/EST数据库中过滤的cDNA克隆与RetinalExpress比较并找到了26种RetinalExpress独特的cDNA/EST, 并且cDNA/EST表达的转录产物被逆转录-PCR和原位杂交证实。26种鼠新基因的部分核酸序列特异出现于RetinalExpress cDNA、EST数据库表明了基因电脑克隆的可行性。 (2) 通过多序列比对从基因组DNA序列中预测新基因[4]:从基因组序列预测新基因, 本质上是把基因组中编码蛋白质的区域和非编码蛋白质的区域区分开来。从理论方法来讲, 就是

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