抗菌肽SMAP-29结构功能及分子设计策略.pdfVIP

生 物 工程 学报 ChinJBiotech2011，June25；27(6)：846—859 ChineseJournalofBiotechnology ISSN 1000—3061 journals．im．ac．cn @2011CJB，Allrightsreserved． cjb@irn．ac．ca 抗菌肽SMAP29结构功能及分子设计策略 陈琛 ，吴三桥 ，李新生 ，张小莺2 闫茂仓 l 陕西理丁学院 陕西省资源生物重点实验室，汉中 723000 2 西北农林科技大学动物医学院，杨凌 712100 3 浙江省海洋水产养殖研究所，温州 325005 摘 要：抗菌肽是生物体内产生的一种具有生物活性的小分子多肽，具有广谱抗细菌、抗病毒、抗真菌甚至抗癌作用。 SMAP一29是来源于绵羊骨髓细胞，包含 29个氨基酸的Cathelicidin类 Ⅱ-螺旋结构抗菌肽。SMAP一29具有多种生物活性 ， 包括抗革兰氏阳／阴性菌、抗真菌、抗病毒、抗寄生虫、抗螺旋体、抗衣原体和中和 内毒素活性，并且具有作用机制独 特 、快速杀灭细菌的特点。以下综述 了SMAP一29抗菌肽家族的基 因和蛋 白结构、结构与活性关系、作用机制、生物功 能、基 因重组表达，重点阐述 了SMAP．29结构、分子设计的必要性和基于SMAP-29一级、二级结构进行分子设计策 略，为SMAP一29药物设计和研究开发奠定 了基础。 关键词 ：抗菌肽，SMAP一29，活性 ，结构与功能 ，分子设计 Structure，functionandmoleculardesignstrategiesof antibacterialpeptideSM AP--29：areview ChenChen，SanqiaoWu，XinshengLi，XiaoyingZhang，andMaocangYan 1ShaanxiKeyLaboratoryofResourceBiology，ShaanxiUniversityofTechnoloyg，Hanzhong723000，China 2CollegeofVeterinaryMedicine，NorthwestA＆FUniversiyt，Yangling712100，China 3Zh~iangMaricultureResearchInstitute，Wenzhou325005，China Abstract： Antibacterialpeptidesareafamilyofhost—defensepeptidesmostofwhicharegene—encodedandproducedby livingorganismsofalltypes．Antibacterialpeptidesaresmallmolecularproteinswithbroadantimicrobialspectrum against bacteria，viruses，fungiandsometimesevenasanticancerpeptide．SM AP一29，acathelicidin—likepeptidederivedfrom sheep myeloid，line ．helicalSturcture，exertsa powerfulbroad antimicrobialactivity againstdifferentpathogens including Gram．positiveandGram-negativebacteria，fungi，viruses，parasites，spirochaetes，chlamydiaandantiendotoxinactivity，and particularantibacterialmechanism，rapidlytopermeabilizemembranesofsusceptibleorganisms．Thispapersummarizesthe latelyresearchprogressofSMAP．29andVariantsincludingthecharacteristicsofstructure，structure—activityrelationsh