鸭1号染色体上能基因的物理定位及其比较基因组学研究.pdf

摘 要 insim 应用荧光原位杂交技术(Fluorescence 理图谱为生物的进化研究及功能基因的克隆鉴定等提供了重要依据。为丰富鸭的物理图谱及鸭与 鸡等模式生物的比较物理图谱，本研究从NCBI序列数据库中筛选了10个鸭的功能基因 factor low density (adiponectinreceptor2，ADIPOR2；Insulin-likegrowth l，IGFl；very cell Hl receptor apolipoprotein皿apoVLDL-II；Tantigena)4，CD4；histonegone,HI；Toll-like kinase 7,TLR7； APRAAC；cyclin-dependentinhibitor,CDKNIB； alpha-A-crystallin, 设计特异PeR引物，利用四维二步PCR法从本实验室构建的鸭BAC文库中筛选含有目标基因的 BAC克隆，以鸭BACDNA为探针、鸭胚成纤维细胞制备的中期染色体为杂交标本，对上述10个鸭 功能基因进行物理定位。用lO个基因的荧光原位杂交结果与鸭标准化G一带模式图比较，其定位 H1， ATPIBI， lql．1-lql．2· 用这lO个基因与鸡上已经进行了物理定位的4个基因进行比较，位于鸡lpl．4-1q2．1这个区 段上，分布于着丝粒两侧。相应的鸭的这四个基因的定位结果位于鸭lpl．3．1q2．1的区段上，说明 在鸭1号染色体上的物理定位以及在鸡l号染色体上的物理图谱的相比较，可以看出这lO个基 因在鸭与鸡l号染色体的同线性并不完全一致，位于着丝粒附近的3个基因ATPIBI、CD4和 apoVLDL-lI的同线性发生了变化，而其它7个基因的同线性一致，说明鸭和鸡的l号染色体上 靠近着丝粒的区段在进化过程中发生了重摊，而远离着丝粒的区段基因的排列顺序相对比较保 守。 四个基因相对比较集中，且分别定位于鸭1号染色体上Ipl．卜lql．3区段、小鼠6号染色体上的 的这三个区段保守程度较高。但这4个基因在这3个物种上的同线性关系都不一致，可能是因为 在漫长的进化的过程中发生了重捧． 关键诃：荧光原位杂交(HSH)，物理定位，G-带，鸭，鸡 Abstract The and Weleconstructedthefluorescence map,which in physicalmapcomparativephysical using situ intotheevolutionof the ofthe Hybridization(FtSh0，willprovideinsight sped∞and cloning fimctinnal ordertoconstructthe ofduckandthe genes．In physicalmap comparativephysical