元胞自动机中斑图复制的识别算法.pdfVIP

第27卷第2期 长春工业大学学报(自然科学版) V01．27。No．2 of of ScienceEdition)Jun．2006 2006年6月 JournalChangchunUniversityTechonology(Natural 文章编号：1006—2939(2006)02一0139-03 元胞自动机中斑图复制的识别算法 闰 满， 李万龙 (长春工业大学计算机科学与工程学院，吉林长春 130012) 摘要：给出了元胞自动机中斑图复制识别的一种算法。通过定义每个元胞的特征数，将两个斑图统一放入 一个区域内比较它们的特征数，从而判定是否出现复制现象。数值例子表明．该算法是有效的。 关键词：元胞自动机；自我复制；斑图 中图分类号：TP301．6 文献标识码：A 0 引 言 该基因组被复制。这个问题也可以转变成如何查 找长度L的基因组中与长度为Z的基因片段n，， 元胞自动机是空间、时间完全离散，状态变量 只取有限数值集的动力系统[1]。研究结果表明， …姗。为此，先给出下面的概念。 存在一类特殊的元胞自动机，即自我复制元胞自 元胞自动机中每个元胞的状态变量取4个 动机[2~4]，不论它的构造还是动力学理论的研究值：n。=(A，丁，C，G)，代表4种碱基，其中f∈[1， 都是特别重要的。从理论上判定哪个元胞自动机 z]。为了定义基因组的特征数H，将上面的4个 出现复制现象是困难的，甚至是不可判定的。但 是，对于给定的元胞自动机，可以通过算法实现这 段的特征数为： 一点。目前，有3种方法构造自我复制元胞自动 f Ho=：口i4H (1) 机： f譬1 (1)Von Neu— Neumann方法。使用Von 这样的特征数与基因片段一一对应[川。在￡ mann定义的4种功能组件完成元胞自动机的构时刻时，元胞自动机的结果为L长的基因组，记 造。这种方法比较复杂，虽然在理论上证明了存 为z。，…，z。，那么，它包含意=L—Z个长为Z的基 在性，但目前仍没有在数值上实现[5]。 因片段。因此，将得到忌个特征数： (2)Langton环路。根据Codd通道的特点， j 可以完成这种类型动态结构的自我复制元胞自动 q一∑曩4H歹∈[1，是] (2) i11 机的设计。 四状态元胞自动机中，在任一时刻的长L的 (3)Kauffman类型。即随机网络元胞自动 基因组z。，…，z。中，存在长Z的基因片段的条件 机，这种类型的特点是在Wolfram第四类元胞自 为：存在，”∈[1，忌]，使得H。=H。。事实上，对这 动机中寻找能自我复制的结构。根据Kauffman 样的m，给出基因片段z，JI，z肼l，…，z。+f。由于 的观点，自我复制结构是必然出现的[6]。文中正 H。=H。，以及特征数与基因片