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- 2022-09-03 发布于安徽
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一、质粒DNA的提取 主要方法: 碱变性法 煮沸法 SDS法 羟基磷灰石层析法等 各方法分离是依据宿主菌株类型、质粒分子大小、碱基组成及结构等特点加以选择的,其中碱变性法既经济且收得率较高,提取的质粒DNA可用于酶切,连接与转化。 4)加200μl新配制的溶液Ⅱ。盖紧管口,快速颠倒Ep管5次以混合内容物。轻微振荡,将Ep管放置于冰上5min。 5)加150μl用冰预冷的溶液Ⅲ。盖紧管口,温和颠倒数次使混匀,溶液Ⅲ在粘稠的细菌裂解物中分散均匀,之后将管置于冰上5 min。 6)室温12 000rpm离心10min,取上清 转移到另一Ep管中。 7)加等量酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),振荡混匀,4℃12 000rpm离心5min,取上清 转移到另一Ep管中。 电泳步骤: 1.配胶:取1g琼脂糖放入100ml的1*TAE缓冲液中,加热2min使溶化,冷却至600C后加入EB (5 μl)至终浓度为0.5 μg/ml,混匀。 2.将凝胶趁热导入先前准备好的胶板中,达到3-5mm厚。冷却至完全凝固。 3.取胶放入电泳槽,将产物与6*Buffer 混匀后,进样。 4.上样端接负极,另一端接正极,开始电泳,25min. 5.取凝胶,观察。 * WenZhou Medical College 检验医学院、生命科学学院 WenZhou Medical College 检验医学院、生命科学学院 * WenZhou Medical College 检验医学院、生命科学学院 WenZhou Medical College 检验医学院、生命科学学院 * WenZhou Medical College 检验医学院、生命科学学院 WenZhou Medical College 检验医学院、生命科学学院 碱裂解法 基本原理: 当菌体在NaOH和SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA不复性而呈絮状,离心时可沉淀下来。 主要试剂: 溶液Ⅰ:50 mmol/L 葡萄糖,25 mmol/L Tris.Cl (pH8.0), 10mmol/L EDTA (pH8.0)。 溶液Ⅰ可成批配制,每瓶100ml,高压灭菌15分钟,储存于4℃冰箱。 溶液Ⅱ:0.2 mol/L NaOH (临用前用10mol/L NaOH母液稀释),1% SDS。 溶液Ⅲ:5 mol/L KAc 60ml,冰醋酸 11.5ml, H2O 28.5ml,定容至100ml, 并高压灭菌。溶液终浓度为: K+ 3mol/L, Acˉ 5mol/L。 质粒DNA小量提取步骤: 1)将1.5ml培养物倒入Ep管中,室温 10000rpm离心1min,将剩余的培养物贮存于4℃。 2)弃上清,使细胞沉淀尽可能干燥。 3)将细菌沉淀,所得重悬于100μl用冰预冷的溶液I中,。须确使细菌沉淀在溶液I中完全分散。 8)向上清液加入0.6倍体积异丙醇,混匀后,于-20 ℃放置30-60min. 9 ) 4℃12 000rpm离心10min。 10)弃上清,把Ep管倒扣在吸水纸上,吸干液体。 11)用500μl 70%乙醇于4℃洗涤沉淀,12000rpm离心5min, 弃上清,在空气中使核酸沉淀干燥10 min。(可用吹风机吹干) 12)沉淀溶于30μl TE(含RNaseA20μg/ml),37℃水浴15min以降解RNA分子,-20℃保存备用。 1.提取过程中应尽量保持低温。 2.加入溶液II 和溶液III 后操作应混和,切忌剧烈振荡。 3.提取质粒DNA 过程中除去蛋白很重要,采用酚/氯仿去除蛋白效果较单独用酚或氯仿好,要将蛋白尽量除干净需多次抽提。 注意事项: 二、电泳 实验原理: 溴化乙锭(EB)能够嵌入到DNA分子的碱基对中形成荧光复合物,在紫外线激发下发射荧光。 * WenZhou Medical College 检验医学院、生命科学学院 WenZhou Medical College 检验医学院、生命科学学院 * WenZhou Medical College 检验医学院、生命科学学院 WenZhou Medical College 检验医学院、生命科学学院 * WenZhou Medical College 检验医学院、生命科学学院 WenZhou Medical College 检验医学院、生命科学学院
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