油茶SRAP-PCR反应体系的建立.pdfVIP

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第 35卷 第 5期 南京林业 大学学报 (自然科学版 ) Vo1.35.No.5 2011年9月 JournalofNanjingForestryUniversity(NaturalScienceEdition) Sept.,2011 http://www.nldxb.COB[doi:10.3969/j.issn.1000—2006.2011.05.025] 油茶 SRAP—PCR反应体系的建立 吴莺莺 ,彭方仁 ,郝明灼 ,陈隆升 ,陈永忠 (1.南京林业大学森林资源与环境学院,江苏 南京 210037;2.湖南省林业科学院,湖南 长沙 410004) 摘要:以油茶品种大别山2号和赣兴46为试验材料,利用Me5Em8正反 向引物组合进行了SRAP — PCR反应体系的L。(3)正交试验 ,采用正交设计直观分析及方差分析对影响 SRAP反应的 Taq聚合酶、Mg 、dNTP和引物浓度进行分析,并对模板DNA浓度进行了单因素试验分析。结 果表明,油茶 SRAP—PCR20IxL反应体系的最佳组合为:Taq聚合酶 1.20Ixmol/min、Mg 浓度 1.25mmol/L、dNTP浓度 0.15mmol/L、Primer浓度 0.60I~mol/L、模板DNA含量6Ong,并含有 2 L10xbuffer(Mg“free)。各因素对油茶SRAP—PCR反应的影响大小依次为:dNTP、Mgn、 Taq聚合酶、Primer。 关键词:油茶;SRAP;反应体系;正交设计 中图分类号:$722 文献标志码 :A 文章编号:1000—2006(2011)05—0l12—05 Establishmentreactionsystem oftheSRAP-PCRinCamelliaoleifera wu Yingying ,PENG Fangrenh HAOMingzhuo ,CHEN Longsheng ,CHEN Yongzhong , (1.CollegeofForestResourcesandEnvironment,NamingForestryUniversity,Naming210037,China; 2.HunanForestryAcademy,Changsha410004,China) Abstract:Inthispaper,orthogonaldesigntoSRAP—PCRsystemforCamelliaolefieracuhivarDabieshan2andGanxing 46wasconductedwiththeprimerscombinationofMe5andEm8.Orthogonaldesign—directanalysisandvarianceanalysis wereappliedtooptimizeSRAP-PCR amplificationsystem in4factorssuchas DNA polymerase,Mg2 dNTP and , primer.TemplateDNA wasalsoanalyzedbythesingleelementtest.Theresultsindicatedthatanoptimalreactionsys— tem (20 L)ofSRAP—PCRsystemwasestablished:1.20ixmolfminTaqDNApolymerase1.25mmo~LMg“,0.15 mmot/LdNTP,0.60~moVLprimer,60ngtemplateDNAand2IxL10buffer(Mg“free).And,theorderofeach factorlevelsaffectedontheresultofSRAP—PCR wasdNTP,Mg“,TaqDNA polymeras

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