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四 川 中 医 2008年第26卷第6期 · 26 · J~mrnaJ Ilr Sichuan of Traditiona1 Chinese Medicine V【l1．26．N【1．6．2008 从宏基因组学谈中医整体观的现代化 丁维发 董 婷 曾庆秋 曹旭升 曾 倩 成都中医药大学微免教研室 (心川1成都610075) 2．成那rf1医药大学 (四川1成都610075) 3．成都中医药大学附属医院 (四川 成都610075) 摘要：宏基因组学是近年兴起的一种微生物基因组分析技术，其研究策略强调的是一种整体性，目前已广泛用于 微生物领域研究，其在现代医学领域的应用亦初显苗头。将宏基因组学引入传统医学，是中医学宏观整体思想与现代 科学微观研究技术的有效结合，可弥补中医微观整体之不足，具有独特的应用前景。 关键词：宏基因组学 中医整体观 现代化 中图分类号：R 222．157 文献标识码：A 文章编号：1000—3649(2008)06—0026—03 在地球这个 物种丰富的大环境 中存在着各种各 其简要 研究 流程 如下∞j：样 品采 集 一提取 样 品总 样的微生态环境 ，其 中生物基 因种数量之多是人类 DNA一载体连接 一转化 宿主细胞 一建立宏基组文库 无法想 象 的。近 代5-)子 生物 学研 究表 明 ，环境 中 一 筛选 (测活或探针) 一活性物 的5-)离纯化 一结构 99．8％的微生物是 不能 用常规 的培养方 法培养 的 ， 测定活性评价 一找 出新活性化 合物 一应用性评价。 而其中蕴含着众多具有应用开发价值的微生物及其 这种方法 旨在直接从微环境或共生体 中克隆出其 中 代谢产物L1]。因此为 了研究未能培养或 不可培养 的 存在的所有基 因组 DNA，构建宏基 因组文库 (如此 微 生 物 ， 一 个 全 新 的 理 念——宏 基 因 组 建立的文库 ，理论上可以覆盖环境 中所有微生物 的 (metagenonle)应运 而生。它 自提出后便得到 了广泛 遗传信 息，包含 了可 培养及 不可 培养 的微 生物基 的认可 ，并被不同领域学者用来研究各种生境 中微 因)，进而5-)析筛选 目的基 因或对研究生境的多样性 生物生态及筛选功能基 因，拓展了人类对微 生物多 进行评估 ，它克服了传统纯培养技术 的不足，极 大 样性的认识。人体亦是一个复杂的生态环境 ，中医 地扩展 了微生物资源的利用空 间，增加 了获得新生 学有着数千年 的历史渊源 ，理论独特，对其 已有一 物活性物质的机会。 定的认识 ，从宏基 因组学切入研究 中医整体观 ，为 近年来 国外学者 已广泛应用宏基因组技术开发 中医现代化研究开创 了新的方法与途径。 土壤未培养微 生物及海洋 活性物质，目前 已采用土 1 宏基因组学简述及其应用现状 壤、海洋生物、海水 、人唾液和牛 的瘤 胃等样品成 “宏基 因组 (Metagenome)”最初是 由 Handelsnm 功构建了宏基 因组文库，从而筛选到了各种酶类及 等L2 于 1998年提出，宏的英文为 “nleta一”，具更高层 一 些次生代谢产物等生物活性物质，国内也逐步有 组织结构 和动态变化的含义，它包含 了比可培养微 了相关研究。目前 已有 的研究证实 了利用基因组技 生物大得多 的遗传信息 ，其定义 为生境 中全部微小 术构建微生态环境宏基 因组文库 ，通过功能性筛选 生物遗传物质 的总和，最初用来定义 土壤细菌混合 发现新生物活性物质 ，对其开发利用并获得了新的 基因组。“宏基 因组学”是 一种整 体性 的研究 策略 ， 抗菌素 j，为医药事业 的发展探 索了一条新 研究