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《生物信息学》课程教学大纲 一、课程概况 课程中文名称 生物信息学 课程英文名称 Bioinfromatics 课程编号 课程类别 □公共必修课 □公选课 □院级限选课 □学科基础课 √专业基础课 □专业限选课 □专业任选课 总学时 32 讲授学时 16 实验学时 16 总学分 2 开课单位 农学院 开课系 生物技术系 授课对象 生物技术专业 先修课程 分子生物学 执笔人 审核人 审批人 修订时间 二、课程简介 生物信息学 （Bioinformatics ）是一门交叉科学，它包含了生物信息的获取、加工、存储、分配、 分析、解释等在内的所有方面，它综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具，来阐明和理解大 量生物数据所包含的生物学意义。它随 1990 年人类基因组计划（HGP ）的实施和信息技术的发展而 诞生，现已迅速发展成为当今生命科学最具吸引力和重大的前沿领域，为生物学、计算机科学、数学、 信息科学等专业的高素质人才提供了更广阔的发展天地。 三、课程性质 生物信息学是生物技术专业的必修课程。生物信息学是生命科学领域一门新兴的边缘学科，综合 了生物学、计算机学、信息学、统计学等方面的知识。该学科在学生掌握生物化学、遗传学、分子生 物学以及计算机应用、高等数学等相关知识的基础上开设。通过学习，学生能够加深对分子生物学和 基因工程等课程的理解，并为进一步学习基因组学(genomics)和蛋白质组学(protemics) 奠定基础。 四、课程教学目标 生物信息学是一门交叉学科，是现代生物学研究的重要工具。本课程系统地概括了该学科的核心 内容，包括生物信息学内容，数据的采集、数据库的类型、内容、结构和注释。数据库的检索和数据 库的搜索、序列发育学及序列注释的原理及工具、资源等主要内容。通过系统的学习与实验，让学生 了解生物信息学的基本研究方法，并能掌握应用其中的一些常用方法，以提高学生的科研能力，领会 采用信息学技术去分析和探索大量核酸和蛋白质序列所蕴藏的生命意义的基本思路。学习运用计算机 软件来分析生物学问题，提高用理论来辅助、提高实验的设计和数据分析水平，加强对分子生物学实 验结果的预测与分析等等的能力。 五、理论教学内容及要求 232 （一）、理论讲授部分 第一章 生物信息学概述及数据采集 （2 学时） 【教学目标】 （1）了解《生物信息学》发展简史。 （2 ）理解 《生物信息学》的基本概念、研究的内容，数据是如何采集的。 （3 ）掌握生物信息学》的基本概念、研究的内容，数据是如何采集的。 【学时分配】2 学时 【授课方式】多媒体 【课外学习指导的要求】 1、课外阅读资料 无 2 、作业与思考题 （1）生物信息学及主要内容？ （2 ）生物信息学主要由哪三个组成部分？ （3 ）数据采集的方法及原理？ （4 ）存储在GenBank 中DNA 序列的类型？ （4 ）基因组测序的策略？ 【教学重点和难点】 （1）重点：《生物信息学》的含义和研究内容，如何采集数据。 （2 ）难点：DNA 测序的原理、蛋白质测序的原理。 【授课内容】 A 生物信息学概述 A1 生物信息学的范围 一、什么是生物信息学（A ） 二、计算机在生物信息学中的作用（B ） 三、本书的范围（A ） B 数据采集 233 B1 DNA 、RNA 和蛋白质测序 一、DNA 测序（A ） 二、DNA 序列的类型（A ） 三、基因组测序策略（B ） 四、序列的质量控制（B ） 五、单遍测序（B ） 六 RNA 测序（B ） 七、蛋白质测序（A ） 【授课方法与手段】（可根据需要填写） （1）教学方法 讲授