广西钦州湾牡蛎线粒体COI基因片段变异分析.pdfVIP

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2017-09-12 发布于湖北
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广西钦州湾牡蛎线粒体COI基因片段变异分析.pdf

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2008年2l卷 6期西南农业学报 V01．21 No．6 SouthwestChinaJournalofA culturalSciences 1737 文章编号：1001—4829(2008)06—1737—04 广西钦州湾牡蛎线粒体 CO1基因片段变异分析李咏梅，陈秀荔，彭敏，蒋伟明，杨春玲，马宁，黎铭，曾地刚，陈晓汉 (广西水产研究所遗传育种与健康养殖重点实验室，广西南宁 530021) 摘要：采用PCR方法扩增66个广西钦州湾牡蛎个体的线粒体细胞色素氧化酶 I亚基基因(CO1)片段，纯化后经测序分析，得到 535bp的碱基序列，其中A、T、G、C、A+T和c+G含量分别为23．8％、37．5％、20．5％、18．2％、60．5％和39．5％。比较它们与香港牡蛎和有明巨牡蛎 CO1序列的差异，钦州湾白肉牡蛎与香港牡蛎 CO1序列完全相同，而红肉牡蛎与有明巨牡蛎序列相同。 DNAStar软件对比分析发现3O个突变位点，其中16个位点为转换，14个位点为颠换。MEGA4软件构建 NJ系统进化树显示白肉牡蛎和红肉牡蛎分为不同的2支。据此初步认为广西钦州湾牡蛎可能为2个不同的种群，CO1基因片段可作为分析牡蛎种群遗传和系统发育的分子标记。关键词：牡蛎；细胞色素氧化酶I亚基基因；序列分析中图分类号：$966 文献标识码：A GeneticdiversityofCrassostreafrom QinzhougulfinGuangxi usingmitochondrialCO1genefragmentsequenceanalysis LIYong-mei，CHEN Xiu—li，PENGMin，JIANGWei-uring，YANG Chun—ling，MANing，U Ming，ZENGDi—gang，CHEN Xiaob·an ‘ (TheKeyLaboratoryofAquaticGeneticBreedingandHealthCultivationofGuangxi，GuangxiFisheriesInstitute，GuangxiNanning530021，China) Abstract：AftermitochondfialCO1genefragmentof66QinzhougulfoystersofGuangxiwereamplifiedviaPCR，purifide，535bpnueleotide sequenceswereretrieved．ThecontentofA，T，G，CA +T nadC+Ginthefragmentwere23．8％，37．5％。20．5％ and18．2％ respective— ly，TheseuqencecomparisonwasmadeamongehongkongsisandC．ariakensiswiththem，Qinzhouuglfwhitemeatoysterhadthesamenn— cleotidesequencewithC．hongkougsis．whileredmeatoysterhadtheem enueleotideseuqencewithC．ar／akens／s．Nucleotidevariationsites numberbetweenthetwospceieswas30byDNAStar，inwhich16weretransitionsnad 14were transversions．NJphylogenetietreewasob· minedbyMEGA4，whichshowedthatwhitemeatoysterandredmeatoysterweredifferentbranch．Itwasinduede thatQinzhouuglfoyster maybetwodifferentspeciesfrom Gunagxiprovince．MitoehondrialCOlgenefragmentwassuitabletobeusedasmolecularmrakerforrelated studies．such8stheanalysesofoysterpopulati