生物信息学第15章生物分子网络与生物系统仿真.ppt

第十五章 生物分子网络与生物系统仿真 目录 1. 生物分子网络 2. 生物系统仿真 3. 系统生物学简介 1. 生物分子网络 2. 生物系统仿真 E-CELL Virtual Cell 3. 系统生物学简介 * 代谢网络：生物体内外的生化代谢过程组合成网络，通过分析这样的代谢网络，能更好地显示复杂的生物过程。 基因网络：基因与基因间的相互作用有多种，一个基因的表达可能促进也有可能抑制另外基因的表达，这些相互作用可能是直接的也可能是间接的，要画出一个基因调控网络来表达这些相互作用并不容易。 5个基因的基因调控网络图：圈子表示基因；箭头表示促进作用；横截线“┤”表示抑制作用；虚线表示可能有该作用 蛋白质相互作用网络：研究蛋白质之间的结合作用，为进一步了解生物活动的机制、病理过程、药物设计等与生命过程紧密联系的一系列基础问题提供必要的线索。 E-Cell System是日本庆应义塾大学（Keio University）的研究小组成员编写的能模拟细胞内生化代谢及基因表达的计算机程序。在此软件中，可由用户建立细胞生物学过程模型。 Virtual Cell是由美国国家细胞分析与模拟研究中心（NRCAM）研制的细胞生理活动过程模拟程序。在这个软件中，综合应用了生物化学反应、电生理现象、细胞显微结构等资料，能从细胞的空间位置显示细胞生理事件。研究者可运用Virtual Cell建立实验模型来进行细胞生物学的计算机模拟实验。 *