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代谢组学研究现状与展望 代谢组学是后基因组学时代发展起来的一门新的“组学”学科，是系统生物学的重要组成部分。代谢组学效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想, 利用现代先进的分析手段对生物体液 ( 血浆、尿液、组织提取液等) 中的一些小分子物质进行系统的测量和分析。通过分析外源性物质 ( 如药物、食物、环境等) 对生物体所产生的整体效应, 认识机体的生理病理及生化状态, 结合模式识别和专家系统等分析方法确定生理病理状态下及外源性物质刺激引起的内源性代谢物组的变化规律, 获得表征生物体在特定时间和环境下的整体功能状态与生物标志物 ( 群) 。 代谢组学表征生物体整体功能状态的特点, 与中药的“多组分、多靶点、整体调节, 协同作用”的特点相吻合, 因此是研究系列中药现代化关键科学问题的重要手段。近年来, 代谢组学研究思路与方法在中药药效作用、临床疗效、质量控制、药效物质基础、体内代谢等研究领域得到了广泛应用。但是由于中药的多重复杂性, 中药研究与代谢组学的结合研究中, 存在概念不清、科学问题不明确、缺乏机制性探索等问题。本文试在分析近年来中药代谢组学在中药物质基础研究、中药体内代谢研究以及中药整体药效作用研究等方面应用的基础上, 探讨中药代谢组学的准确定义、适用领域和应用前景。 1 代谢组学及其在中药研究中的应用 代谢组学的概念早在古希腊时期就已出现萌芽, 那时的医生们根据病人尿液的颜色、气味、味道等来判断病人的身体状况。1971 年, Horning首先提出代谢组学 ( metabolomics) 的概念, 是指可以用GC进行分析鉴定的用来表征代谢类型的化合物。2002 年, Nicholson提出了新的代谢组学 ( metabonomics) 概念, 特指用分析化学手段和数学模型检测和表征机体在疾病、药物或毒物影响下体内化学物质发生的变化。在这一概念的指引下, 随后又派生出药物代谢组学 ( pharmacometabolomics) 、细胞代谢组学 ( cellular metabolomics) 等与药效研究、生物化学等学科相结合的概念。尽管Metabolomics和Metabnomics在研究对象和研究目的上有本质的不同, 但由于研究方法的相通性, 现在已基本上混用。 代谢组学已在中药物质基础分析、体内外代谢以及活性研究等中药现代化多个领域得以应用, 虽然研究技术方法相似, 但研究对象和目的具有本质不同, 因此将代谢组学在中药研究领域中的应用统称为“中药代谢组学” ( herbometabolomics) 不妥, 概念混淆可能阻碍代谢组学思路方法在中药关键科学问题研究中的深入应用。 应用代谢组学研究技术, 揭示中药物质基础时, 其研究对象是中药本身所含有的化学成分, 研究目的是揭示中药因产地、储藏、炮制、制剂等因素所产生的化学物质基础的差异, 宜称为中药化学物质组学 ( herbal chemicalomics或herbalomics) 。中药及其各种制剂在进入生物体 ( 动物、人) 后, 其所含的化学成分易在生物体液环境、菌群及各种代谢酶的作用下发生广泛代谢, 形成中药成分在生物体内的代谢产物组 ( herbal metabolome) , 代谢组学技术方法有利于揭示中药在生物体内形成的复杂代谢产物组, 这一应用可称为中药代谢组学 ( herbal metabolomics) 。利用代谢组学方法研究中药对模式生物和人体内源性小分子代谢产物的影响, 从而表征中药的整体生物学效应, 则宜称为中药效应代谢组学 ( herbal efficacy metabolomics) 。目前代谢组学在中药研究中的应用, 均可归纳为这3 种类型。根据研究对象和研究目的明确区分代谢组学的概念和定义, 有利于推动其在中药学不同科学问题研究中的合理应用。 2 质谱分析的应用 色谱质谱联用技术具有高分辨率、高灵敏度、高精确度等特点, 目前已广泛应用于中药物质组学的研究。应用比较广泛的气相色谱-质谱技术 ( GC-MS) 具有传质速度快、分离效能好、检测灵敏度高等优点, 广泛应用于挥发油、生物碱、糖类、脂肪酸类、甾体化合物的分析研究。液相色谱-质谱 ( LC-MS) 的优点非常显著, 它不仅灵敏度高、选择性好, 而且与GC-MS相比, 大大拓宽了可分析样品的范围, 对于一些热不稳定的不易挥发的样品以及一些生物大分子都可进行实时分析。另外, 最近几年发展起来的杂交质谱技术 ( 如LC /MS-Q-TOF, LC / MS-IT-TOF) 以其高灵敏度、高分辨率的特点为复杂的中药代谢组分析开启了新的篇章。 由于毛细管电泳分析技术对极性化合物和带电化合物分析效率较高, 近年来, 其在代谢组学研究中的应用日益广泛。毛细管电泳通过与质谱仪联用更加提高了分析的灵敏度