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  • 2026-01-26 发布于四川
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一、前言演讲人2025-12-17

医学导论:AI药物筛选课件

01ONE前言

前言站在医学院的阶梯教室里,我望着台下四十多双亮晶晶的眼睛——他们是刚接触医学导论课程的大二学生,其中不少人还带着对“药物研发”的浪漫想象:穿白大褂的科研人员在实验室里摇晃试管,偶然间发现某种化合物能杀死癌细胞……直到上周课上,有个戴黑框眼镜的男生举手问:“老师,现在新药研发成功率不到10%,平均耗时10-15年,难道我们只能靠‘碰运气’吗?”

这个问题像一颗小石子,投进了我多年来在药物研发领域的记忆长河。作为曾在药企研发部门工作过八年,如今转向医学教育的“跨界人”,我太清楚传统药物筛选的痛点:从靶点确认到化合物合成,每一步都像在黑暗里摸象——高通量筛选(HTS)虽能同时测试数万种化合物,却像大海捞针;分子对接模拟依赖经验参数,常与实际结合力偏差20%以上;更不必说临床前试验失败率高达90%,平均每个新药要“烧掉”26亿美元。

前言直到2019年,我参与某药企的抗新冠药物研发项目。团队引入AI平台后,原本需要6-12个月的“苗头化合物”筛选周期,竟压缩到45天——这不是科幻小说里的情节,而是真实发生的技术革命。今天,我想带大家走进这个“AI重新定义药物筛选”的时代,用一个真实案例串起整个流程,像剥洋葱一样,从现象到本质,从困惑到解答。

02ONE病例介绍(药物研发“病例”)

病例介绍(药物研发“病例”)2022年初,我接到某生物制药公司的合作邀请,他们正在开发一款针对非小细胞肺癌(NSCLC)的靶向药物。传统路径下,研发团队已锁定了一个热门靶点——MET受体酪氨酸激酶,但在化合物筛选阶段卡了壳:实验室合成的2000个候选分子中,仅12个能与靶点有效结合,且其中8个存在肝毒性风险。项目组急得像热锅上的蚂蚁:“再这么筛下去,临床申报时间要延后一年,竞品都要上市了!”

这时,公司决定引入AI药物筛选平台。我作为技术顾问参与了整个过程。项目组首先整理了三部分数据:一是公开数据库中5000个与MET激酶结合的化合物结构及活性数据(包括IC50值、ADMET属性);二是内部10年积累的3000个失败分子的“负面数据”(如哪些基团易导致肝毒性);三是通过冷冻电镜解析的MET激酶高分辨率三维结构(分辨率1.8?)。

病例介绍(药物研发“病例”)AI系统基于这些数据,构建了多任务学习模型:既预测化合物与靶点的结合亲和力(用分子动力学模拟验证),又同步评估其药代动力学(ADME)和毒性(T)属性。更关键的是,模型引入了“可解释性模块”——它不仅能给出“这个分子好”的结论,还能标出分子中哪些基团贡献了结合力,哪些部分可能引发毒性。

三个月后,AI输出了前20个候选分子。实验验证时,18个分子的结合活性(Ki值)达到纳摩尔级别,其中5个分子的肝毒性预测值比传统筛选的最优分子低40%。最终,项目组选中的“MET-007”分子,在小鼠模型中显示出82%的肿瘤抑制率,且无明显肝肾损伤——这个原本可能“夭折”的项目,因AI筛选重获生机。

03ONE护理评估(AI药物筛选的“全流程体检”)

护理评估(AI药物筛选的“全流程体检”)如果把AI药物筛选比作一场手术,“护理评估”就是术前对患者(研发项目)、设备(AI系统)、环境(数据与团队)的全面检查。在MET项目中,我们的评估分了三个维度:

“患者”评估:项目需求是否清晰?药物筛选不是“为了AI而AI”,必须明确核心目标。比如,这个项目的优先级是“高活性+低毒性”,而非单纯追求“结合力最强”。我们与研发团队反复确认:临床前阶段最担心的是“毒性导致的失败”(历史数据显示,35%的候选药因肝毒性折戟),因此模型权重设置为“毒性预测占40%,结合力占30%,ADME占30%”。

“设备”评估:AI工具是否适配?当时市场上有十几种AI药物筛选平台,我们逐一“体检”:有的模型只擅长小分子设计,对激酶这类大分子靶点精度不足;有的依赖单一数据源(如仅用ChEMBL数据库),忽略了企业内部的“失败数据”(这些数据往往比成功数据更珍贵)。最终选中的平台具备“多模态学习”能力——能同时处理分子结构(SMILES字符串)、蛋白质三维结构(PDB文件)、实验数据(表格)等多种数据类型,且支持“迁移学习”(用公开数据预训练,再用企业数据微调)。

“环境”评估:数据与团队是否“无菌”?数据质量是AI的“血液”。我们花了两周时间清洗数据:剔除重复记录(比如同一分子在不同文献中的不同命名)、校正错误的IC50值(有些实验因操作误差导致数据偏离均值3倍以上)、标注“负面数据”的具体失败原因(如“肝毒性由CYP3A4抑制引起”而非笼统的“毒性”)。同时,团队构成必须“跨界”——除了计算化学、生物学专家,还需要AI工程师(懂分子表示方法)、临床前药理学

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